2015年中国典型对虾养殖区WSSV流行株高变异区序列的分析比较

• 作者: 万晓媛 刘庆慧 孙新颖 秦梦雪 黄倢
• 来源期刊: 渔业科学进展
• 学科: 农学
• 关键词: WSSV ORF 缺失 变异
• 年，卷（期）: 2018,（2）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 128-137
• 页数: 10页
• 分类号: S945
• 字数: 4573字
• 语种: 中文
• DOI: 10.19663/j.issn2095-9869.20170108001

摘要

为了解我国白斑综合征病毒(WSSV)流行变异特征,本研究对2015年4-10月期间在山东、江苏、天津、浙江、海南和广东6省市采集到的57份WSSV阳性的样本,通过特异性的扩增目的片段,根据测序结果分析比较不同地区、不同分离株之间在ORF14/15、ORF23/24上的缺失变异情况,以及ORF75、ORF94和ORF125上的重复单元(Repeat unit,RU)数目差异.结果显示,在ORF14/15扩增中,分别有6530、5908和5725 bp的片段缺失,而在ORF23/24扩增中均有12070 bp大片段的缺失,ORF75的45 bp的RU数目分别为1、2和3,102 bp的RU数目均为1,而ORF94的RU数目分别为4、5、10和12不等,ORF125的RU数目为3、5和6.结果表明,WSSV在部分开放型阅读框上表现出明显的变异差异,而在某些开放型阅读框上的缺失情况则有显著的稳定性.