毛竹GRF转录因子家族的全基因组鉴定与分析

• 作者: 何龙燕 刘武阳 娄永峰 肖复明
• 来源期刊: 植物科学学报
• 学科: 生物学
• 关键词: 毛竹 GRF 基因家族 表达分析
• 年，卷（期）: 2018,（5）
• 所属期刊栏目: 遗传与育种
• 页码范围: 713-720
• 页数: 8页
• 分类号: Q943.2
• 语种: 中文
• DOI: 10.11913/PSJ.2095-0837.2018.50713

摘要

利用生物信息学方法,于毛竹(Phyllostachys edulis (Carr.) Lehaie)全基因组中鉴定获得18个GRF转录因子,并对其理化特性、保守结构域、系统发育关系、miR396靶位点以及基因表达模式进行了分析.结果表明,18个PeGRF蛋白长度为170～551 aa,分子量为18.5～58.8 kD;这些PeGRF蛋白均具有QLQ和WRC结构域,部分PeGRF含有FFD和TQL保守结构域.对毛竹、拟南芥(Arabidopsis thaliana(L.)Heynh)和水稻(Oryza sativa L.)的系统进化分析结果显示,毛竹18个GRF可分为3个亚类,且单子叶植物毛竹和水稻的GRF转录因子亲缘关系更近.miR396靶位点预测分析结果发现,在13个PeGRF基因序列的编码区存在毛竹miR396结合位点;PeGRF基因表达模式分析结果显示,PeGRF主要在毛竹的竹笋中表达.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	肖复明	江西省林业科学院江西省植物生物技术重点实验室	116	2244	27.0	43.0
2	何龙燕	江西农业大学江西省森林培育重点实验室	1	3	1.0	1.0
6	娄永峰	江西省林业科学院江西省植物生物技术重点实验室	7	7	2.0	2.0