无绿藻PCR ITS1-ITS2基因分型法的建立及应用

• 作者: 刘锦燕 孟玲宁 朱巍巍 李文静 王珏婷 赵悦 项明洁
• 来源期刊: 中国真菌学杂志
• 学科: 医学
• 关键词: 无绿藻 无绿藻病 基因型 鉴定 ITS区
• 年，卷（期）: 2018,（1）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 4-7
• 页数: 4页
• 分类号: R379.9
• 字数: 2812字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1673-3827.2018.01.002

摘要

目的 建立无绿藻(Prototheca) PCR ITS1-ITS2基因鉴定分型方法,并通过系统发育树以研究各型别无绿藻菌株间的亲缘关系.方法 抽提5株无绿藻临床分离菌株的DNA,通过特异性引物扩增ITS1及ITS2区后,根据该区域核苷酸片段的差异进行基因分型,借助MEGA6.0软件建立系统发育树,并通过SSU rDNA测序加以验证.结果 5株菌株中,1株鉴定为P.zopfii hydrocarbonea,2株鉴定为P.wickerhamii.虽然由于数据库中缺乏P.zopfii portoricensis菌株ITS序列导致1、2号菌株不能被鉴定,但ITS区系统发育树中这两株菌仍被归为P.zopfii中独立的一簇,与SSU rDNA系统发育树相近,证明此分型方法无误.结论 PCR ITS1-ITS2基因分型法可作为一种有效基因分型方法用于鉴定和监测无绿藻感染.