基于计算机辅助水解技术的芝麻寡肽体内转运性质预测

• 作者: 乔连生 刘思佳 张燕玲 李贡宇 陈艳昆 陈茜
• 来源期刊: 北京中医药大学学报
• 学科: 医学
• 关键词: 计算机辅助水解 寡肽 芝麻 支持向量机 寡肽转运蛋白2
• 年，卷（期）: 2018,（3）
• 所属期刊栏目: 中药化学
• 页码范围: 222-226
• 页数: 5页
• 分类号: R284.1
• 字数: 4042字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1006-2157.2018.03.009

摘要

目的 基于计算机辅助技术预测芝麻寡肽的体内转运性质.方法 收集芝麻中主要蛋白序列,以计算机辅助技术进行蛋白模拟消化水解,将水解获得的寡肽构建虚拟结构数据库.构建寡肽转运蛋白2(PepT2)底物的支持向量机(SVM)模型后,通过数据处理和参数寻优方法挑选最优模型,预测芝麻PepT2的底物成分.结果 芝麻寡肽数据库共包括346条寡肽,利用筛选获得45个描述符,创建了PepT2底物的SVM模型,模型的准确度、灵敏度和特异性均在85%以上.经受试者工作特征(ROC)分析,其曲线下面积(AUC) >0.9.利用PepT2底物模型预测芝麻寡肽数据库,发现36%的芝麻寡肽具有通过PepT2转运的潜在活性.结论 利用计算机辅助水解技术构建了中药芝麻寡肽数据库,以PepT2底物SVM模型预测芝麻寡肽的体内转运性质,模型准确、稳定、灵敏、特异性高,为开展寡肽类中药成分的性质研究提供了新的方法.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	张燕玲	北京中医药大学中药学院	90	652	14.0	20.0
2	李贡宇	北京中医药大学中药学院	13	216	6.0	13.0
3	陈茜	北京中医药大学中药学院	7	33	3.0	5.0
4	刘思佳	北京中医药大学中药学院	4	4	1.0	2.0
5	陈艳昆	北京中医药大学中药学院	4	7	2.0	2.0
6	乔连生	北京中医药大学中药学院	6	35	3.0	5.0