八肋游仆虫NMD通路的初步研究

• 作者: 吕佳 张志云 柴宝峰 柴杨丽 王刚 王美 石文鑫
• 来源期刊: 中国细胞生物学学报
• 关键词: 八肋游仆虫 NMD途径 外显子连接复合体 UPF1 Y14
• 年，卷（期）: 2018,（6）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 984-991
• 页数: 8页
• 语种: 中文
• DOI: 10.11844/cjcb.2018.06.0017

摘要

无义介导的mRNA降解(nonsense-mediated mRNA decay,NMD)是一种重要的mRNA质量监测机制,可以识别和降解含有提前终止密码子(premature termination codons,PTCs)的异常转录本,但其详细的分子机制还没有完全阐释清楚.纤毛虫是真核生物进化最早的一个分支,对其NMD途径的研究有助于阐明高等生物基因表达调控的进化与分子机制.该研究从纤毛虫八肋游仆虫(Euplotes octocarinatus)基因组中鉴定并克隆得到NMD因子EuUPF1、EuUPF2、Eu Y14a、EuY14b和EuMA GO的基因.酵母双杂交和体外pull-down实验分析证实了各因子间的相互作用关系:EuUPF1的CH结构域与EuUPF2的C-端结构域相互作用;Y14的两个同源体(paralogs)EuY14a和EuY 14b,作为mRNA结合蛋白,均与EuMAGO发生相互作用,形成真核生物mRNA外显子连接复合体(exon-exon junction complex,EJC)的核心.一方面,EuUPF1的CH结构域与EuY14a直接相互作用,结合到异常mRNA上;另一方面,EuUPF1可以通过EuUPF2与EuMAGO相互作用,后者再与EuY 14a和EuY 14b相互作用,把EuUPF1锚定到异常mRNA上.总之,EuUPF1通过两种方式结合在mRNA上,招募各种核酸酶,降解异常的mRNA.因为游仆虫基因组中内含子含量低于高等真核生物,而又远高于酵母真菌,因此研究者认为,依赖EJC和不依赖EJC的两种NMD途径可能共存于游仆虫细胞中,但这两种NMD途径具体的分子机制有待深入研究.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	张志云		21	72	5.0	8.0
2	柴宝峰		72	1241	15.0	34.0
3	王刚		6	14	3.0	3.0
4	吕佳		5	12	2.0	3.0
5	柴杨丽		4	9	2.0	3.0
6	石文鑫		3	7	1.0	2.0
7	王美		3	7	1.0	2.0