UPF2介导八肋游仆虫NMD途径SURF和EJC的耦联

• 作者: 吕佳 周宝春 柴宝峰 柴杨丽 梁爱华
• 来源期刊: 山西大学学报（自然科学版）
• 学科: 物理学
• 关键词: 八肋游仆虫 NMD UPF2 SURF Y14
• 年，卷（期）: 2019,（3）
• 所属期刊栏目: 生命科学与环境科学
• 页码范围: 646-654
• 页数: 9页
• 分类号: O436
• 字数: 4814字
• 语种: 中文
• DOI: 10.13451/j.cnki.shanxi.univ(nat.sci.).2018.10.12.001

摘要

通过生物信息学分析发现八肋游仆虫的UPF2 (EoUPF2)包含三个串联的MIF4G(middle domain of translation initiation factor 4G)结构域和一个C末端UPF1的结合区域.对24种UPF2氨基酸序列的进化关系分析发现,EoUPF2与酿酒酵母的UPF2(ScUPF2)进化关系较为接近.InterPro database数据库分析结果显示,二者的核心结构域非常相似.酵母双杂交和Pull down实验证实:EoUPF2的C末端与EoUPF1的CH结构域相互作用;EoUPF2在没有UPF3存在的情况下,通过其MIF4G结构与外显子连接复合体(exon-exon junction complex,EJC)核心因子Y14a和Y14b相互作用.β-半乳糖苷酶实验证实EoUPF2与Y14a的作用更强一些.qPCR分析结果排除了EoUPF2与Y14a和Y14b相互作用与Y14a和Y14b本身的拷贝数有关.由此我们推断,在八肋游仆虫的NMD识别无义mRNA过程中,EoUPF2通过与Y14相互作用,介导了UPF1与无义mRNA上的外显子连接复合体的耦联,启动了无义mRNA的识别过程.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	梁爱华	山西大学生物技术研究所化学生物学与分子工程教育部重点实验室	97	555	13.0	18.0
2	柴宝峰	山西大学生物技术研究所化学生物学与分子工程教育部重点实验室	72	1241	15.0	34.0
3	吕佳	山西大学生物技术研究所化学生物学与分子工程教育部重点实验室	5	12	2.0	3.0
4	柴杨丽	山西大学生物技术研究所化学生物学与分子工程教育部重点实验室	4	9	2.0	3.0
5	周宝春	山西大学生物技术研究所化学生物学与分子工程教育部重点实验室	3	2	1.0	1.0