不同猪种IGF1R基因扩增及SNPs的筛选

• 作者: 张明国 李常红 杨睿 胡玮宜 郝林琳 魏文珍
• 来源期刊: 吉林农业大学学报
• 学科: 农学
• 关键词: 猪 IGF1R基因 SNPs 基因型 连锁不平衡
• 年，卷（期）: 2018,（6）
• 页码范围: 734-739
• 页数: 6页
• 分类号: S828
• 语种: 中文
• DOI: 10.13327/j.jjlau.2018.4639

摘要

以小型猪(巴马香猪46头)和大型猪(长白猪、大白猪、杜洛克猪,共198头)为试验对象,采用PCR产物直接测序法对胰岛素样生长因子1受体(IGF1R)外显子进行SNPs筛查,根据测序结果确定每个SNP位点的基因型,并通过Haploview软件对筛选到的SNPs进行连锁不平衡及单倍型分析.结果表明:在不同体型猪IGF1R基因外显子121上共筛选到9处同义SNPs位点,为G263C(rs338724264)、T17G(rs325909655)、C145T(rs337838116)、T40C(rs326728191)、C104T(rs319719983)、C170T(rs338444971)、C60T(rs327750836)、C126T(rs327750836)和C82T(rs339449791).这9个SNPs在巴马香猪和大型猪中均为纯合子突变,且呈现完全连锁不平衡.此研究明确了不同体型猪IGF1R基因外显子区SNPs的基因型及由这些SNPs形成的优势单倍型,可为探究不同猪种生长发育过程中体尺存在差异的原因提供新数据.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	郝林琳	吉林大学动物科学学院	57	250	8.0	12.0
2	杨睿	吉林大学动物科学学院	3	3	1.0	1.0
3	李常红	白城师范学院生命科学学院	9	13	2.0	3.0
4	胡玮宜	吉林大学动物科学学院	1	2	1.0	1.0
5	魏文珍	吉林大学动物科学学院	1	2	1.0	1.0