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细脚拟青霉腺苷酸琥珀酸合酶基因的克隆与表达分析
细脚拟青霉腺苷酸琥珀酸合酶基因的克隆与表达分析
作者:
姚宇
李秀兰
杜林娜
杨晶
陈鸿兵
魏东旭
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
细脚拟青霉
腺苷酸琥珀酸合酶
基因克隆
序列分析
表达分析
摘要:
腺苷酸琥珀酸合酶(ADSS)为细脚拟青霉(Paecilomyces tenuipes)有效成分腺苷合成代谢途径的关键酶,而细脚拟青霉中腺苷酸琥珀酸合酶基因Ptadss的克隆与序列分析鲜见相关报道.本文在细脚拟青霉转录组测序结果的基础上,利用PCR技术克隆得到该菌Ptadss基因的cDNA序列,对Ptadss基因及其编码的蛋白进行生物信息学分析(相关理化性质、结构域、亲水性-疏水性、亚细胞定位、信号肽和高级结构等),并构建PtADSS与相关微生物ADSS的系统进化树.同时,采用实时荧光定量PCR技术,分析Ptadss基因在不同发酵阶段的细脚拟青霉菌丝体中的表达量,以初步明确该基因的表达量对于细脚拟青霉腺苷含量的影响.结果表明:克隆得到的Ptadss基因的ORF序列为1670 bp.该基因编码的蛋白的基本性质为:423个氨基酸残基、相对分子量为46.7663 kDa、等电点(pI)为5.59,含58个磷酸化位点,且该蛋白为定位于细胞质中的非分泌性和非跨膜的疏水性蛋白.结构预测结果表明该蛋白是由α-螺旋、β-转角、延伸链和无规则卷曲组成的复杂结构.序列分析结果提示,细脚拟青霉Ptadss基因与Cordyceps confragosa腺苷酸琥珀酸合酶基因同源性最高,可达91%.结合其他微生物的ADSS氨基酸序列构建系统树,结果表明细脚拟青霉与Cordyceps confragosa亲缘关系较近.另经对不同发酵阶段的细脚拟青霉中Ptadss的表达量及腺苷含量分析结果表明:Ptadss基因的表达水平与菌丝体中腺苷含量存在正相关性.
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文献信息
篇名
细脚拟青霉腺苷酸琥珀酸合酶基因的克隆与表达分析
来源期刊
黑龙江农业科学
学科
关键词
细脚拟青霉
腺苷酸琥珀酸合酶
基因克隆
序列分析
表达分析
年,卷(期)
2018,(6)
所属期刊栏目
遗传育种·生物技术
研究方向
页码范围
11-16
页数
6页
分类号
字数
4092字
语种
中文
DOI
10.11942/j.issn1002-2767.2018.06.0011
五维指标
作者信息
序号
姓名
单位
发文数
被引次数
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1
杜林娜
吉林农业大学生命科学学院
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李秀兰
吉林农业大学生命科学学院
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魏东旭
吉林农业大学生命科学学院
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陈鸿兵
吉林农业大学生命科学学院
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吉林农业大学生命科学学院
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细脚拟青霉
腺苷酸琥珀酸合酶
基因克隆
序列分析
表达分析
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研究分支
研究去脉
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黑龙江农业科学
主办单位:
黑龙江省农业科学院编辑出版中心
出版周期:
月刊
ISSN:
1002-2767
CN:
23-1204/S
开本:
大16开
出版地:
哈尔滨市南岗区学府路368号
邮发代号:
14-61
创刊时间:
1978
语种:
chi
出版文献量(篇)
8933
总下载数(次)
26
总被引数(次)
31227
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