库尔勒香梨PsiERF基因的克隆和表达分析

• 作者: 全绍文 周丽 徐航 牛建新 马丽
• 来源期刊: 新疆农业科学
• 学科: 农学
• 关键词: 库尔勒香梨 ERF 萼片脱落于宿存 生物信息学
• 年，卷（期）: 2018,（9）
• 所属期刊栏目: 园艺·林业
• 页码范围: 1616-1625
• 页数: 10页
• 分类号: S611.2
• 字数: 6297字
• 语种: 中文
• DOI: 10.6048/j.issn.1001-4330.2018.09.006

摘要

[目的]筛选克隆库尔勒香梨萼片脱落与宿存的相关基因,研究其在脱萼样品与宿萼样品中表达.[方法]以库尔勒香梨脱萼和宿萼花器官转录组测序数据为基础,从Unigenes中选出一条转录组和数字表达谱测序结果共有的与萼片脱落宿存相关的具有AP2/ERF结构域的差异基因,命名为PsiERF,对其进行生物信息学分析,通过实时荧光定量PCR分析其在花期不同阶段不同器官中的表达量.[结果]PsiERF cDNA序列的长度是1195 bp,包含一个编码264个氨基酸长度为795 bp的开放阅读框(ORF),一个123 bp的5'端非编码区和一个277 bp的3'端非编码区.库尔勒香梨的PsiERF的核酸与氨基酸序列与其他植物的ERF109基因具有高度的同源性.实时荧光定量结果显示,其在全花样本中,宿萼组全花样品表达量在所有时期均高于脱萼组全花样品,而在宿萼组样品末花期萼片表达量极显著高于子房.[结论]筛选、克隆并鉴定一个新的库尔勒香梨PsiERF基因,该基因属于AP2/ERF家族中的ERF亚家族,与库尔勒香梨的萼片宿存脱落存在密切关系.