3个白桦细胞色素P450基因生物信息学及表达分析

• 作者: 孙璐 尹静 李影 杨杰 林香雨 王思瑶 翟睿 詹亚光
• 来源期刊: 南京林业大学学报（自然科学版）
• 学科: 农学
• 关键词: 白桦 BpCYP450 表达模式分析 生物信息学分析
• 年，卷（期）: 2018,（6）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 27-34
• 页数: 8页
• 分类号: Q786|S792.153
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1000-2006.201803002

摘要

[目的]研究白桦细胞色素P450基因表达的组织特异性,以及在茉莉酸甲酯(MeJA)、水杨酸(SA)、赤霉素(GA3)、脱落酸(ABA)、乙烯利和伤害处理下的基因表达模式.[方法]筛选白桦转录组,获得3个BpCYP450基因,分别命名为BpCYP4、BpCYP5、BpCYP14,利用生物信息学分析BpCYP450蛋白的分子结构特征及其与其他物种CYP450蛋白的亲缘关系.采用QRT-PCR技术,对白桦BpCYP450组织特异性、激素信号及伤害诱导下的表达特征进行分析.[结果]生物信息学结果表明BpCYP4、BpCYP5、BpCYP14 cDNA序列长度分别为1569、1584和1530 bp,具有完整的开放阅读框(ORF),分别编码522、527和509个氨基酸,均为亲水性跨膜蛋白,主要定位于叶绿体.白桦BpCYP450与百脉根、扁豆及豌豆等豆科植物CYP450蛋白亲缘性较高.组织特异性分析结果显示,3个BpCYP450基因在叶和根中表达较高,茎中较低.激素信号及伤害诱导结果表明,3个BpCYP450基因不同程度地响应MeJA、SA、GA3、ABA、乙烯利激素信号及伤害诱导.[结论]3个BpCYP450基因均为CYP450基因家族的新成员,具有组织特异性及激素诱导表达特性,可能在白桦生长发育、抵御胁迫及代谢物合成中发挥重要作用.