斯氏副柔线虫CAMK/TSSK蛋白激酶基因的克隆及其蛋白质结构与抗原表位预测分析

• 作者: 冯陈晨 刘春霞 孙柯 王姝懿 王文龙 王梦雅 白丽艳 赵学亮
• 来源期刊: 畜牧兽医学报
• 学科: 农学
• 关键词: 斯氏副柔线虫 CTPK基因 抗原表位 蛋白质结构预测 生物信息学分析 丝/苏氨酸蛋白激酶
• 年，卷（期）: 2018,（3）
• 所属期刊栏目: 研究简报
• 页码范围: 644-651
• 页数: 8页
• 分类号: S852.731
• 字数: 6179字
• 语种: 中文
• DOI: 10.11843/j.issn.0366-6964.2018.03.023

摘要

为分析并预测斯氏副柔线虫免疫相关基因CTPK编码蛋白结构、功能以及其作为疫苗候选抗原的可能性,通过提取斯氏副柔线虫组织RNA,反转录合成cDNA,设计特异性引物以扩增CTPK基因的CDS区,并利用生物信息学软件对CTPK进行蛋白质结构分析和抗原表位预测.生物信息学分析表明,CTPK基因cDNA序列全长共519 bp,具有完整的开放阅读框(519 bp),编码173个氨基酸,相对分子质量和等电点大小分别为20.264 ku和9.53.结构分析发现,蛋白质无跨膜区,无规则卷曲构成二级结构的主要组分,亲水性氨基酸比例超过60％;抗原表位预测表明,CTPK蛋白是一种抗原性较高的亲水性蛋白,既含有较多潜在的B细胞抗原表位又存在较多的T细胞抗原表位.推测CTPK有望用作斯氏副柔线虫的免疫诊断抗原和疫苗候选抗原,本研究为骆驼斯氏副柔线虫生前诊断方法iELISA的建立和DNA疫苗的研究奠定了理论基础.