中甸犏牛SLC11A1基因3'非翻译区多态位点研究及其与抗病性关联的评估

• 作者: 席冬梅 李国治 李鹏 熊和丽 王利平 邓卫东
• 来源期刊: 河南农业科学
• 学科: 农学
• 关键词: SLC11A1基因 中甸犏牛 3'UTR 微卫星多态性(GT)n
• 年，卷（期）: 2018,（9）
• 所属期刊栏目: 畜牧·兽医
• 页码范围: 131-137
• 页数: 7页
• 分类号: S82
• 字数: 4420字
• 语种: 中文
• DOI: 10.15933/j.cnki.1004-3268.2018.09.022

摘要

为研究中甸犏牛溶质载体转运蛋白基因(SLC11A1)的结构变异情况,并评估结构变异与抗病性的关联,采集了114个样品,扩增了SLC11A1基因3'非翻译区(3'UTR)部分序列,测序共检测到3个微卫星多态位点(MS1、MS2、MS3)和3个核苷酸变异(1782位点T→G、1805位点G→A、1907位点G→T),其中MS1有6个等位基因(GT10、GT12、GT14—17)、MS2有3个等位基因(GT5—7)、MS3有5个等位基因(GT12—16).GT12/15、GT5/5、GT13/13基因型频率最高,分别为0.204、0.05、0.324;GT15、GT5、GT13等位基因频率最高分别为0.284、0.685、0.433.对MS1、MS2、MS3这3个多态位点进行单倍型分析,发现了44种单倍型,其中GT12/5/13为优势单倍型,频率为0.13.χ2比较分析表明,中甸犏牛与婆罗门瘤牛 × 布兰科牛、荷斯坦牛 × 布兰科牛、布兰科牛、非洲牛MS1位点的GT12/12基因型频率差异显著(P<0.01),与西班牙黄牛、荷兰黄牛MS3的GT13/13基因型频率差异显著(P<0.01),与非洲黄牛差异不显著(P>0.05).综上,中甸犏牛SLC11A1基因3'UTR具有丰富的多态性,推断其GT12/12和GT13/13纯合子基因型与抗病性相关.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	李国治	云南农业大学动物科学技术学院	50	425	11.0	19.0
2	邓卫东	云南农业大学动物科学技术学院	92	620	14.0	19.0
3	席冬梅	云南农业大学动物科学技术学院	52	303	10.0	15.0
4	王利平	云南农业大学动物科学技术学院	7	46	4.0	6.0
6	李鹏	新乡学院生命科学与技术学院	22	24	3.0	4.0
9	熊和丽	云南农业大学动物科学技术学院	8	11	2.0	3.0