基于玛氏骨条藻转录组的脂肪酸合成途径分析

• 作者: 张梅 王华龙 甄毓 米铁柱
• 来源期刊: 中国海洋大学学报（自然科学版）
• 学科: 地球科学
• 关键词: 玛氏骨条藻 脂肪酸合成 转录组
• 年，卷（期）: 2018,（4）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 81-93
• 页数: 13页
• 分类号: X173
• 字数: 6948字
• 语种: 中文
• DOI: 10.16441/j.cnki.hdxb.20160383

摘要

本研究利用Illumina Hiseq2000对不同生长时期的玛氏骨条藻(Skeletonema marinoi)进行转录组测序,得到的转录本通过NR、NT、Swiss-Prot和KOG数据库进行功能分类,通过GO和KEGG数据库进行相关代谢途径分析和基因差异表达分析,在此基础上构建了S.marinoi的脂肪酸生物合成途径,发现共存在26种酶和蛋白对应的33个编码基因,对这33个基因序列进行比对发现其与假微型海链藻(Thalassiosira pseudonana)的同源性较高.在该代谢通路中,S.marinoi在不同生长时期出现显著差异表达的基因有15个.与指数期相比,柠檬酸裂解酶和长链酰基-CoA合成酶(Comp14198_c0)的编码基因在稳定期和衰亡期出现显著下调表达,而柠檬酸合酶的编码基因仅在稳定期出现显著下调表达.与之相反的是,以乙酰-CoA羧化酶编码基因为代表的12个编码基因在稳定期和衰亡期均出现了显著上调.通过分析,初步推测S.marinoi在稳定期的脂肪酸合成能力高于指数期.这些信息为海洋微藻脂肪酸生物合成途径的研究提供了理论基础,有助于对S.marinoi进行基因改造,提高脂肪酸的合成量.同时,又能为赤潮的防治提供新的思路.