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基于玛氏骨条藻转录组的细胞死亡相关功能基因解析
基于玛氏骨条藻转录组的细胞死亡相关功能基因解析
作者:
于志刚
刘乾
王华龙
甄毓
米铁柱
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
玛氏骨条藻
转录组分析
细胞死亡
摘要:
本研究以玛氏骨条藻(Skeletonema marinoi)转录组信息为基础,发现玛氏骨条藻中存在26个与细胞死亡相关的酶以及37个编码这些酶的基因.这些编码基因的序列比对结果表明,其与假微型海链藻(Thalassiosira pseudonana)和大洋海链藻(Thalassiosira oceanica)的同源基因具有较高的一致性.对这些样品进行数字基因表达谱的差异基因分析,获得了不同生长时期时与细胞死亡过程有关的编码基因的差异表达数据.结果发现,在稳定期和衰亡期,与抗氧化胁迫作用相关的关键酶(如过氧化物酶5、铜锌超氧化物歧化酶)、与RNA的加工与降解过程有关的功能基因(如多核糖核苷酸核苷转移酶、5,~3'核糖核酸外切酶2)以及细胞死亡特异蛋白的基因表达量显著高于指数期.本论文主要是通过对转录组数据进行分析得到基因转录组水平差异表达结果,为蛋白水平研究提供一种可能性变化趋势和潜在数据依据,同时为以后研究提供数据基础及研究方向.本研究也为进一步探讨硅藻的细胞死亡机制奠定了基础,也为深入理解赤潮的消亡过程提供了新的视角.
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文献信息
篇名
基于玛氏骨条藻转录组的细胞死亡相关功能基因解析
来源期刊
中国海洋大学学报(自然科学版)
学科
生物学
关键词
玛氏骨条藻
转录组分析
细胞死亡
年,卷(期)
2017,(4)
所属期刊栏目
研究论文
研究方向
页码范围
58-65
页数
8页
分类号
Q178.53
字数
4685字
语种
中文
DOI
10.16441/j.cnki.hdxb.20160210
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节点文献
玛氏骨条藻
转录组分析
细胞死亡
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
中国海洋大学学报(自然科学版)
主办单位:
中国海洋大学
出版周期:
月刊
ISSN:
1672-5174
CN:
37-1414/P
开本:
大16开
出版地:
青岛市松岭路238号
邮发代号:
24-31
创刊时间:
1959
语种:
chi
出版文献量(篇)
4553
总下载数(次)
21
总被引数(次)
47584
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