基于转录组测序的花生籽粒不同发育时期油脂合成相关基因差异表达分析

• 作者: 徐媛 李惠敏 李璐璐 秦新民 陈玉梅 陈锦玲
• 来源期刊: 河南农业科学
• 学科: 农学
• 关键词: 花生 转录组 差异表达分析 油脂合成相关基因
• 年，卷（期）: 2019,（7）
• 所属期刊栏目: 作物栽培·遗传育种
• 页码范围: 24-37
• 页数: 14页
• 分类号: S565.2|S330.2
• 字数: 7954字
• 语种: 中文
• DOI: 10.15933/j.cnki.1004-3268.2019.07.005

摘要

为研究花生籽粒不同发育时期油脂合成过程中基因的表达调控模式,对花后20、35、50、60 d的花生籽粒(分别表示为HS20、HS35、HS50、HS60)进行转录组测序.通过对转录组测序数据进行分析,HS20、HS35、HS50、HS60样品的文库分别获得了109321068、106867224、109313082、107123540条Clean reads.将得到的花生籽粒转录组数据按发育时期的先后顺序进行两两比对,HS20-vs-HS35、HS35-vs-HS50和HS50-vs-HS60的差异表达基因总数分别是25769、18403、12308个,其中上调表达基因分别占12.55％ 、62.92％ 、26.28％.对差异表达基因进行KEGG Pathway分析,得到135条代谢通路,其中与油脂合成相关的有脂肪酸生物合成、不饱和脂肪酸生物合成、脂肪酸延长、脂肪酸代谢、花生四烯酸代谢等代谢通路.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	秦新民	广西师范大学生命科学学院	74	526	13.0	17.0
2	李惠敏	广西师范大学生命科学学院	35	250	10.0	15.0
3	徐媛	广西师范大学生命科学学院	5	3	1.0	1.0
4	陈玉梅	广西师范大学生命科学学院	9	10	1.0	3.0
5	陈锦玲	广西师范大学生命科学学院	5	3	1.0	1.0
6	李璐璐	广西师范大学生命科学学院	9	3	1.0	1.0