基于组合模型的转录调控网络构建算法研究

• 作者: 刘晓燕 张诚诚 邢林林 郭茂祖
• 来源期刊: 计算机科学与探索
• 学科: 工学
• 关键词: 转录调控网络 深度自编码器 XGBoost 逻辑回归
• 年，卷（期）: 2018,（7）
• 所属期刊栏目: 人工智能与模式识别
• 页码范围: 1154-1161
• 页数: 8页
• 分类号: TP391
• 字数: 4551字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3778/j.issn.1673-9418.1705043

摘要

转录调控网络一直是系统生物学和生物信息学领域的一个研究热点.构建转录调控网络为揭示细胞 内的生化反应机制提供了重要的手段.目前该领域的研究存在生物数据利用不充分,基因转录调控网络构建精度低等问题,尤其是在比较大的数据集上.针对以上问题,充分利用基因表达数据、基因序列数据和基因注释数据,提出了基于深度自编码器的XGBoost和逻辑回归组合模型DAXL(combined model with XGBoost and logistic regression based on deep AutoEncoder).最后,在拟南芥数据集上进行了实验,结果表明DAXL方法提高了转录调控网络的预测精度,并且较对比方法优势明显.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	刘晓燕	哈尔滨工业大学计算机科学与技术学院	35	237	8.0	14.0
2	邢林林	哈尔滨工业大学计算机科学与技术学院	4	3	1.0	1.0
3	郭茂祖	北京建筑大学电气与信息工程学院	18	49	4.0	6.0
4	张诚诚	哈尔滨工业大学计算机科学与技术学院	1	0	0.0	0.0