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Speedy A蛋白调控相关miRNA的筛选及miR-23b靶标的验证
Speedy A蛋白调控相关miRNA的筛选及miR-23b靶标的验证
作者:
丁宁
刘美玲
张瑶楠
李媛媛
贾孟春
闫丽
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
Speedy A
miR-23b
生物信息学
双荧光素酶报告系统
摘要:
目的 筛选和鉴定调控Speedy A蛋白表达的miRNAs. 方法 通过在线数据库TargetScan、miRNA和miR-walk预测与Speedy A相互作用的miRNAs,并结合本实验室前期建立的精原细胞和精母细胞小RNA数据库,筛选出评分较高的候选miRNAs.实时定量PCR检测小鼠7、14、21、35、64 d睾丸中候选miRNAs和Speedy A基因的表达,筛选出表达趋势呈显著负相关的miRNAs.构建野生型Speedy A基因3’端非翻译区荧光素酶报告基因载体(WT-Speedy A-3,UTR)及miR-23b靶序列突变型载体(mut-Speedy A-3'UTR),分四组转染HEK-293T细胞株:野生型实验组,WT-Speedy A-3,UTR质粒+miR-23b mimic;野生型对照组,WT-Speedy A-3'UTR质粒+miR-23b mimic NC;突变型实验组,mut-Speedy A-3'UTR质粒+miR-23b mimic;突变型对照组:mut-Speedy A-3'UTR质粒+miR-23b mimic NC,双荧光素酶报告基因系统检测荧光素酶活性. 结果 通过生物信息学方法结合本实验室前期建立的精原细胞和精母细胞小RNA数据库筛选出4个评分较高的miRNA:miR-23b、miR-143、miR-345-3p和miR-881.实时荧光定量PCR检测不同发育时期小鼠睾丸中以上4种miRNAs和Speedy A基因的表达水平,结果显示在不同发育时期的小鼠睾丸中,miR-23b的表达趋势与Speedy A呈显著负相关(P<0.01).成功构建了重组野生型/突变型(WT/mut) Speedy A3’-UTR载体,通过双荧光素酶报告基因检测显示野生型实验组相比对照组吸光值明显降低,差异有统计学意义(P<0.01). 结论 野生型实验组对其它3组对照组荧光活性有明显的抑制作用,证实miR-23b能够靶向调控Speedy A基因的表达.
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高通量测序
miRNA
靶基因
内容分析
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内容分析
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关键词热度
相关文献总数
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(/年)
文献信息
篇名
Speedy A蛋白调控相关miRNA的筛选及miR-23b靶标的验证
来源期刊
生殖医学杂志
学科
关键词
Speedy A
miR-23b
生物信息学
双荧光素酶报告系统
年,卷(期)
2018,(2)
所属期刊栏目
实验研究
研究方向
页码范围
159-165
页数
7页
分类号
字数
5640字
语种
中文
DOI
10.3969/j.issn.1004-3845.2018.02.012
五维指标
作者信息
序号
姓名
单位
发文数
被引次数
H指数
G指数
1
闫丽
4
19
2.0
4.0
2
贾孟春
国家卫生计生委科学技术研究所国家卫生计生委男性生殖健康重点实验室
3
1
1.0
1.0
3
李媛媛
2
1
1.0
1.0
4
张瑶楠
国家卫生计生委科学技术研究所国家卫生计生委男性生殖健康重点实验室
3
2
1.0
1.0
5
刘美玲
国家卫生计生委科学技术研究所国家卫生计生委男性生殖健康重点实验室
3
6
1.0
2.0
6
丁宁
国家卫生计生委科学技术研究所国家卫生计生委男性生殖健康重点实验室
1
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传播情况
被引次数趋势
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引文网络
引文网络
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参考文献
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二级引证文献(0)
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引证文献(1)
二级引证文献(0)
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节点文献
Speedy A
miR-23b
生物信息学
双荧光素酶报告系统
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
生殖医学杂志
主办单位:
北京协和医院
国家人口计生委科学技术研究所
出版周期:
月刊
ISSN:
1004-3845
CN:
11-4645/R
开本:
大16开
出版地:
北京市帅府园1号
邮发代号:
80-419
创刊时间:
1992
语种:
chi
出版文献量(篇)
4211
总下载数(次)
9
总被引数(次)
22615
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