芸薹属AC基因组MTP1基因的生物信息学分析

• 作者: 李施蒙
• 来源期刊: 广东农业科学
• 学科: 农学
• 关键词: 甘蓝型油菜 MTP1基因 重金属耐受蛋白 锌 CDF家族 生物信息学
• 年，卷（期）: 2018,（9）
• 所属期刊栏目: 作物栽培·遗传育种
• 页码范围: 21-27
• 页数: 7页
• 分类号: S565.4
• 字数: 4647字
• 语种: 中文
• DOI: 10.16768/j.issn.1004-874X.2018.09.004

摘要

以拟南芥(Arabidopsis thaliana)AtMTP1基因序列为参考,利用白菜(Brassica rapa)、甘蓝(Brassica oleracea)、甘蓝型油菜(Brassica napus)全基因组数据对MTP1基因进行全基因组水平鉴定,通过Blastn比对和保守结构域分析,在芸薹属AC基因组中共鉴定到8个MTP1基因,其中白菜1个、甘蓝3个、甘蓝型油菜4个(A亚基因组3个、C亚基因组1个).生物信息学分析结果表明,在蛋白质理化性质、二级结构、跨膜结构域、磷酸化位点等方面,3个物种中的MTP1基因间各有差异,并使用甘蓝型油菜转录组数据比较分析4个BnMTP1基因在不同组织部位的表达模式.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	李施蒙	西藏自治区农牧科学院农业研究所	7	0	0.0	0.0