猪PKM2基因的序列分析与组织表达及亚细胞定位

• 作者: 付言峰 任守文 周李生 方晓敏 李碧侠 涂枫 王学敏 赵为民
• 来源期刊: 湖南农业大学学报（自然科学版）
• 学科: 农学
• 关键词: 猪 PKM2基因 序列分析 组织表达 亚细胞定位
• 年，卷（期）: 2019,（1）
• 所属期刊栏目: 畜牧·兽医·水产
• 页码范围: 68-77
• 页数: 10页
• 分类号: S828
• 字数: 4833字
• 语种: 中文
• DOI: 10.13331/j.cnki.jhau.2019.01.012

摘要

运用RT-PCR技术克隆猪PKM2基因的编码区序列,对该序列进行生物信息学分析,研究PKM2基因的组织表达及亚细胞定位.结果显示:猪PKM2基因CDS全长1596 bp,编码531个氨基酸;预测其蛋白相对分子质量为5.79×104,等电点为7.96,含有多个磷酸化位点,为稳定蛋白;PKM2蛋白含有丙酮酸激酶家族的barrel domain和alpha/beta domain 2个结构域,其蛋白二级结构中α-螺旋和无规则卷曲占主要类型;猪PKM2蛋白序列在物种间非常保守,系统进化树分析表明,该蛋白与兔的亲缘关系最近;组织表达显示,猪PKM2基因在肾、小肠中相对高表达,而在肝脏与肌肉中相对低表达;亚细胞定位显示,PKM2蛋白在猪3D4/21和PK15细胞中表达于细胞质,而不表达于细胞核.