侵染红肉火龙果的蟹爪兰X病毒贵州分离物基因组分析

• 作者: 王壮 王小柯 郑乾明 马玉华
• 来源期刊: 植物病理学报
• 学科: 农学
• 关键词: 复制酶 外壳蛋白 核苷酸 序列一致性
• 年，卷（期）: 2019,（2）
• 所属期刊栏目: 细胞生物学、生理学、生物化学、分子生物学
• 页码范围: 219-225
• 页数: 7页
• 分类号: S432.41
• 语种: 中文
• DOI: 10.13926/j.cnki.apps.000377

摘要

通过高通量测序和RT-PCR扩增,克隆并分析蟹爪兰X病毒(Zygocactus virusX,ZyVX)贵州分离物ZyVX-GZ基因组序列.对表现病毒病症状的红肉火龙果植株进行高通量测序,获得4条ZyVX相关contig.RT-PCR扩增并拼接获得ZyVX-GZ基因组,全长为6 567 nt,5'-UTR和3'-UTR分别为60 nt和70 nt.含有5个ORF,分别编码复制酶蛋白、TGB1、TGB2、TGB3蛋白和外壳蛋白.ZyVX-GZ与P39和B1分离物基因组序列一致性均为91％.TGB 1-3、外壳蛋白基因与大多数分离物核苷酸和推导的氨基酸序列一致性分别为95％～99％和96％～100％;复制酶基因的核苷酸和推导的氨基酸序列一致性分别为80％～89％和92％～97％.系统进化分析表明,ZyVX群体的遗传分化与寄主种类、地理分布不存在相关性.本研究结果丰富了ZyVX群体的基因组序列信息,为ZyVX的监测和防控提供了基础.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	王壮		11	12	2.0	3.0
2	马玉华		26	25	2.0	4.0
3	郑乾明		9	1	1.0	1.0
4	王小柯		9	2	1.0	1.0