绵羊IGF-Ⅰ基因Ⅱ类变异剪接体生物信息学及组织表达分析

• 作者: 亓美玉 付晶 姚玉昌 宋旭婷 张嘉楠 王志鹏 翟羽飞
• 来源期刊: 中国畜牧杂志
• 学科: 农学
• 关键词: 绵羊 IGF-Ⅰ基因 变异剪接体 生物信息学分析 组织表达
• 年，卷（期）: 2019,（1）
• 所属期刊栏目: 遗传育种
• 页码范围: 46-51
• 页数: 6页
• 分类号: S826.2
• 字数: 4636字
• 语种: 中文
• DOI: 10.19556/j.0258-7033.2019-01-046

摘要

为明确绵羊IGF-Ⅰ 基因变异剪接体的生物学特性及其在生长发育过程中的功能,本研究成功获得了IGF-Ⅰ 基因 Ⅱ 类的2种变异剪接体(Ea和Eb型),利用生物信息学方法预测分析2种变异剪接体的结构特性,并探讨其在不同组织中的表达规律.结果表明:Ea和Eb型由同一基因通过选择性剪切形成,均是绵羊中新发现的类型,预测其分别编码138 aa和172 aa,2种变异剪接体的信号肽剪切位点、进化同源性、亚细胞定位、蛋白质空间结构预测结果类似,但二者包含不同的共价修饰位点.组织表达分析表明,2种变异剪接体在肝组织中表达量均最高,其次为脂肪、胃、睾丸、肌肉和皮肤组织,心、脾、肺、肾、肠、膀胱组织的表达水平较低;在胃中,羔羊期2种变异剪接体表达水平均极显著高于成羊期(P<0.01),在睾丸中,羔羊期IGF-Ⅰ 基因 Ⅱ类Ea型表达水平显著高于成羊期(P<0.05).总体上来看,在各种组织中IGF-Ⅰ 基因 Ⅱ 类Ea型的表达水平高于Eb型,为优势转录本类型.