苏博美利奴羊胚胎期WNT2基因的组织表达及其生物信息学预测分析

• 作者: 付雪峰 何军敏 吴伟伟 哈尼克孜·吐拉甫 徐新明 朱桦 杜建文 杨雪梅 田可川 田月珍 范雪 赵冰茹 阿布来提·苏来曼 陈华峰 黄锡霞
• 来源期刊: 新疆农业科学
• 学科: 农学
• 关键词: WNT2基因 表达量 转录因子 密码子 系统进化树
• 年，卷（期）: 2019,（12）
• 所属期刊栏目: 农产品安全·植物保护·畜牧兽医
• 页码范围: 2320-2328
• 页数: 9页
• 分类号: S826|S852.3
• 字数: 5478字
• 语种: 中文
• DOI: 10.6048/j.issn.1001-4330.2019.12.019

摘要

[目的]检测WNT2基因在苏博美利奴羊胚胎期135 d不同组织中的表达水平,了解WNT2基因的分子结构和进化特征,从分子水平及进化特征上研究苏博美利奴羊的组织器官与WNT2基因表达之间的内在联系,为筛选细毛羊毛囊发育相关候选基因提供理论依据.[方法]采用qRT-PCR法研究苏博美利奴羊毛囊成熟时期WNT2基因在不同组织中的表达,并使用PROMO软件预测WNT2基因启动子区域序列的转录因子,并用Cytoscape_v3.5.1软件可视化,使用MEGA 7.0软件分析WNT2基因启动子区域序列的核苷酸组成成分及密码子的偏好性,并且利用绵羊、山羊、牛、人等9个物种的WNT2基因的DNA序列构建系统进化树.[结果]WNT2基因在皮肤组织中的表达量极显著高于心脏、肝脏、脾脏、肺脏、肾脏及肌肉组织.在绵羊WNT2基因启动子区域序列共预测出101个相关转录因子,4种碱基呈现均匀分布,CAG与UCU是使用相对较多的密码子,对WNT2基因的DNA序列系统进化树分析发现山羊和绵羊之间的进化关系比与其他哺乳动物进行比较时更为接近.[结论]建立了胚胎期135 d的苏博美利奴羊的不同组织中WNT2基因表达量的RT-PCR方法,并使用生物信息学软件对其分子结构和进化特征进行分析.