小鼠后肢特异表达基因的筛选及验证

• 作者: 周宇荀 李凯 段维旺 王茂春 肖君华
• 来源期刊: 中国实验动物学报
• 学科: 生物学
• 关键词: 基因芯片 肢体发育 后肢特异表达 小鼠
• 年，卷（期）: 2019,（1）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 1-6
• 页数: 6页
• 分类号: Q95-33
• 字数: 2929字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1005-4847.2019.01.001

摘要

目的 对比小鼠前后肢基因表达谱的变化,筛选小鼠后肢特异表达的基因.方法 通过NCBI GEO数据库查找小鼠前后肢基因表达芯片,使用Transcriptome Analysis Console软件对原始数据(5个前肢E10.5 d芯片及4个后肢E10.5 d芯片)进行质控,利用差异倍数为2倍以上或0.5倍以下及P值小于0.05进行数据过滤,绘制差异表达基因的火山图,并进行聚类分析,构建后肢特异表达基因的相互作用分子网络图.结果 小鼠胚胎E10.5 d后肢相较于前肢的差异表达的基因共有275个,其中上调的基因45个,下调的基因230个,构建了后肢特异表达的差异基因分子网络图,找到后肢特异表达核心基因,使用qPCR检测部分后肢特异表达的基因,结果与芯片结果一致.结论 应用小鼠表达谱芯片成功筛选出后肢特异表达的基因,为哺乳动物肢体发育的研究提供基础.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	肖君华	东华大学生物研究所	58	137	7.0	9.0
2	李凯	东华大学生物研究所	58	122	6.0	9.0
3	周宇荀	东华大学生物研究所	53	102	6.0	9.0
4	王茂春	东华大学生物研究所	6	0	0.0	0.0
5	段维旺	东华大学生物研究所	2	0	0.0	0.0