野生矮牡丹高通量转录组测序分析

• 作者: 李文广 李萍 王炳华 胡桃花 郝兴宇 韩晓丽 黄春国
• 来源期刊: 激光生物学报
• 学科: 农学
• 关键词: 稷山矮牡丹 转录组测序 基因分析 功能注释
• 年，卷（期）: 2019,（4）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 360-367
• 页数: 8页
• 分类号: S58
• 字数: 5650字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1007-7146.2019.04.010

摘要

为探究野生稷山矮牡丹(Paeonia jishanensis)花青素等抗氧化活性物质生物合成的遗传基础,本文采用高通量测序技术Illumina NextSeqTM500对其幼嫩叶片、嫩茎和花芽混合池样本进行转录组测序分析.共获得39 450个unigene,其中3 563个unigene中有4 106个SSR位点.在Swiss Prot数据库中注释到29 420个unigene,其中11个与花青素生物合成过程相关,22个与类黄酮生物合成过程相关,15个与异黄酮生物合成过程相关;NR数据库中注释高达100％,有12个与类黄酮生物合成相关,7个与花青素生物合成相关;GO数据库中注释到24 291个unigene,分为生物学过程、细胞组分及分子功能等三大类53个功能组,有21个unigene与黄酮、黄酮醇及异黄酮生物合成有关,4个unigene与花青素合成有关;eggNOG数据库中注释到38 238个unigene,涉及植物生长发育过程绝大多数生命活动过程;KEGG数据库注释到5 709个unigene,分别定位到6大类别42个代谢途径,其中25个unigene与花青素生物合成相关.研究表明,在稷山矮牡丹转录组序列中,共鉴定和发掘出多个涉及类黄酮化合物生物合成、花青素生物合成过程的相关基因序列及SSR位点,为下一步开展相关代谢合成途径研究奠定了基础.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	郝兴宇	山西农业大学农学院	53	636	14.0	23.0
2	李萍	山西农业大学农学院	36	318	10.0	16.0
3	韩晓丽	山西农业大学林学院	6	4	1.0	2.0
4	黄春国	山西农业大学农学院	15	99	5.0	9.0
5	李文广	山西农业大学农学院	3	4	1.0	2.0
6	胡桃花		8	0	0.0	0.0
7	王炳华		1	0	0.0	0.0