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香蕉苯丙氨酸解氨酶基因家族的全基因组鉴定及表达分析
香蕉苯丙氨酸解氨酶基因家族的全基因组鉴定及表达分析
作者:
孙媛媛
徐碧玉
杨会晓
王卓
贾彩红
金志强
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
香蕉
苯丙氨酸解氨酶
系统进化分析
表达分析
基因家族
摘要:
苯丙氨酸解氨酶(Phenylalanine ammonia-lyase,PAL)是催化苯丙烷代谢途径第1步反应的限速酶,广泛地参与植物生长发育过程中的各种生理活动.本研究通过生物信息学分析,从香蕉A基因组数据库中利用BLASTp筛选出53个可能的MaPAL编码蛋白序列.在NCBI分析蛋白保守结构域,发现仅有8个基因具有典型的PAL家族基因的特性.聚类分析结果表明香蕉MaPAL家族的8个基因可以分为Class I和Class II两类.转录组数据表明,所有MaPAL基因在果实发育阶段高表达,MaPAL5参与果实采后成熟过程.在干旱、低温、盐处理的香蕉幼苗叶片中,MaPAL1、MaPAL2、MaPAL3、MaPAL4和MaPAL5成员均显著上调表达,MaPAL6号成员显著下调表达,这些成员参与香蕉响应上述非生物胁迫过程.8个MaPAL成员在枯萎病菌处理下均显著下调表达,表明在感病品种巴西蕉根系中,MaPAL基因的表达全部被Foc TR4抑制.本研究结果为分析MaPAL基因家族在香蕉果实品质形成和响应逆境中的作用提供了理论依据.
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苯丙氨酸解氨酶
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篇名
香蕉苯丙氨酸解氨酶基因家族的全基因组鉴定及表达分析
来源期刊
热带作物学报
学科
农学
关键词
香蕉
苯丙氨酸解氨酶
系统进化分析
表达分析
基因家族
年,卷(期)
2019,(10)
所属期刊栏目
热带植物基因组学与基因编辑专题
研究方向
页码范围
1949-1957
页数
9页
分类号
S668.1
字数
4495字
语种
中文
DOI
10.3969/j.issn.1000-2561.2019.10.007
五维指标
传播情况
被引次数趋势
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期刊影响力
热带作物学报
主办单位:
中国热带作物学会
出版周期:
月刊
ISSN:
1000-2561
CN:
46-1019/S
开本:
大16开
出版地:
海南省海口市龙华区学院路4号
邮发代号:
创刊时间:
1980
语种:
chi
出版文献量(篇)
5760
总下载数(次)
12
总被引数(次)
35220
相关基金
国家自然科学基金
英文译名:
the National Natural Science Foundation of China
官方网址:
http://www.nsfc.gov.cn/
项目类型:
青年科学基金项目(面上项目)
学科类型:
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