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摘要:
目的 探讨H7N9流感病毒神经氨酸酶(neuraminidase,NA)基因非翻译区(untranslated region,UTR)可变区碱基多态性对NA基因转录与翻译的影响.方法 通过生物信息学方法分析H7N9流感病毒NA基因UTR的可变区碱基多态性位点,人工合成N9-UTR可变区随机突变文库.利用自主构建的RNA聚合酶I eGFP报告系统,构建N9-3'UTR-eGFP-5'UTR RNA聚合酶I随机突变荧光报告文库.从N9-UTR突变荧光报告文库中随机挑选克隆转染H1N1流感病毒辅助感染的MDCK细胞,荧光显微镜观察eGFP的荧光表达,同时用多功能酶标仪定量检测eGFP的相对荧光强度;利用 β-actin作为内参,采用实时荧光RT-PCR定量检测eGFP基因的转录变化.测序鉴定eGFP上调或下调的N9-UTR克隆并分析导致eGFP表达变化的UTR可变区SNP特征.结果 随机筛选了6个N9-UTR可变区随机突变荧光报告克隆,发现N9-2克隆的eGFP下调,而N9-7克隆eGFP上调.测序分析发现突变核苷酸位点位于5'UTR的27位,eGFP上调表现为A27G.结论 H7N9流感病毒NA基因的5'UTR可变区A27G突变可增强NA基因转录与翻译.
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文献信息
篇名 H7N9流感病毒NA基因5'UTR可变区 A27G突变可增强NA基因转录与翻译
来源期刊 国际病毒学杂志 学科
关键词 H7N9流感病毒 eGFP N9-UTR RNA聚合酶I报告系统
年,卷(期) 2019,(6) 所属期刊栏目 流感、禽流感流行病学及病原学进化研究
研究方向 页码范围 365-369
页数 5页 分类号
字数 3009字 语种 中文
DOI 10.3760/cma.j.issn.1673-4092.2019.06.002
五维指标
作者信息
序号 姓名 单位 发文数 被引次数 H指数 G指数
1 房师松 深圳市疾病预防控制中心传染病预防控制所 91 425 12.0 16.0
2 王昕 深圳市疾病预防控制中心传染病预防控制所 51 166 9.0 11.0
3 武伟华 深圳市疾病预防控制中心传染病预防控制所 22 30 3.0 5.0
4 彭博 深圳市疾病预防控制中心传染病预防控制所 20 21 2.0 4.0
5 刘慧 深圳市疾病预防控制中心传染病预防控制所 15 10 2.0 2.0
6 孙颖 深圳市疾病预防控制中心传染病预防控制所 4 1 1.0 1.0
7 唐秀娟 深圳市疾病预防控制中心传染病预防控制所 25 157 8.0 11.0
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H7N9流感病毒
eGFP
N9-UTR
RNA聚合酶I报告系统
研究起点
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相关学者/机构
期刊影响力
国际病毒学杂志
双月刊
1673-4092
11-5394/R
16开
北京市东城区和平里中街16号
18-223
1994
chi
出版文献量(篇)
1932
总下载数(次)
20
总被引数(次)
7372
相关基金
国家自然科学基金
英文译名:the National Natural Science Foundation of China
官方网址:http://www.nsfc.gov.cn/
项目类型:青年科学基金项目(面上项目)
学科类型:数理科学
论文1v1指导