小鼠NFATc1相互作用蛋白功能及KEGG通路分析

• 作者: 宋丽华 李钰娜 栗学清 武翠玲 裴晋红 郑军 黄燕
• 来源期刊: 长治医学院学报
• 学科: 医学
• 关键词: 活化T细胞核因子胞浆Ⅰ型 GO富集分析 KEGG信号通路 DAVID
• 年，卷（期）: 2019,（4）
• 所属期刊栏目: 基础研究
• 页码范围: 241-243,262
• 页数: 4页
• 分类号: R392
• 字数: 1829字
• 语种: 中文

摘要

目的:利用生物信息学方法对小鼠NFATc1及相关蛋白功能进行预测与分析,为探讨NFATc1生物学功能及作用机制提供借鉴.方法:利用在线数据库STRING,选取系统打分高于0.800的20种蛋白质与NFATc1构建蛋白相互作用网络图,并对该蛋白集合进行后续分析;采用DAVID在线分析工具对以上蛋白进行GO功能富集和KEGG信号通路分析.结果:GO富集分析显示,该蛋白集合参与CaN/NFAT信号通路、转录正调控、JUN蛋白磷酸化、基因表达正调控等生物学过程.具体分子功能主要是结合转录因子、钙依赖蛋白丝氨酸/苏氨酸磷酸酶活性、JUN蛋白激酶活性及RNA聚合酶Ⅱ核心启动子近端序列特异性结合DNA等;KEGG信号通路分析显示,该蛋白集合主要富集于破骨细胞分化代谢、Wnt信号通路、T细胞受体信号通路、B细胞受体信号通路等.结论:NFATc1及其相关蛋白生物学功能具有广泛性,其原因可能与参与多种细胞信号转导通路相关.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	郑军	长治医学院基础医学部生物化学教研室	14	68	3.0	8.0
2	宋丽华	长治医学院药学系	50	234	9.0	13.0
3	栗学清	长治医学院基础医学部生物化学教研室	14	12	2.0	3.0
4	武翠玲	长治医学院基础医学部生物化学教研室	13	41	5.0	6.0
5	裴晋红	长治医学院基础医学部生物化学教研室	18	20	2.0	4.0
6	黄燕	长治医学院基础医学部生物化学教研室	15	13	2.0	3.0
7	李钰娜	长治医学院基础医学部生物化学教研室	9	4	1.0	2.0