基于lncRNA-miRNA-mRNA的ceRNA网络构建筛选老年胶质母细胞瘤相关lncRNAs

• 作者: 周志威 李文鹏 李镇宜 邓跃飞 陈钦标 雷炳禧 黄毓涛
• 来源期刊: 岭南急诊医学杂志
• 关键词: 老年患者 胶质母细胞瘤 lncRNA ceRNA网络
• 年，卷（期）: 2019,（2）
• 所属期刊栏目: 论著与临床
• 页码范围: 114-117
• 页数: 4页
• 字数: 2571字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1671-301X.2019.02.005

摘要

目的:识别老年胶质母细胞瘤患者相关lncRNA(Long non-coding RNA,长链非编码RNA).方法:从TCGA数据库下载TCGA-GBM RNA-seq、miRNA-seq、clinical数据.将样本按照年龄大于70岁和小于70岁进行分组.利用edgeR软件进行lncRNA、miRNA、mRNA的差异表达分析.利用miRanda软件分别预测miRNA的mRNA靶基因以及miRNA的lncRNA靶基因.针对筛选出的差异lncRNA和差异mRNA,进行表达相关性分析.根据lncRNA-mRNA相关性分析以及miRNA靶基因分析结果,构建ceRNA网络.结果:根据本文的筛选条件共筛选得到48个lncRNA-miRNA-mRNA调控网络.结论:筛选得到7个lncRNA及48个ceRNA网络可作为老年胶质母细胞瘤患者的生物学标志物进行研究.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	邓跃飞	中山大学孙逸仙纪念医院神经外科	43	182	8.0	10.0
2	陈钦标	中山大学孙逸仙纪念医院神经外科	4	0	0.0	0.0
3	周志威	中山大学孙逸仙纪念医院神经外科	5	0	0.0	0.0
4	李文鹏	中山大学孙逸仙纪念医院神经外科	5	4	2.0	2.0
5	李镇宜	广东省广州市增城区中医医院老年病科	2	0	0.0	0.0
6	黄毓涛	中山大学孙逸仙纪念医院神经外科	1	0	0.0	0.0
7	雷炳禧	中山大学孙逸仙纪念医院神经外科	1	0	0.0	0.0