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摘要:
目的 研究桂枝中酚类提取物木脂素的潜在作用靶点.方法 在药效团模型数据库中筛选出与木脂素衍生物匹配值(FitValue)大于0.75的药效团模型;运用反向对接技术,从上述药效团模型所对应的靶点蛋白中挑选出与木脂素衍生物结合能最低的蛋白;以该靶蛋白已报道的抑制剂建立3D-QSAR药效团模型预测木脂素衍生物的活性,同时通过荧光偏振实验测试化合物1与Tankyrase 1蛋白的结合力,通过Western blot实验测试加入化合物1后细胞中Tankyrase 1蛋白的含量变化;最后用分子动力学模拟分析木脂素衍生物与该蛋白的作用模式.结果 与木脂素衍生物匹配值大于0.75的药效团模型有17个,其中4个为神经保护类靶点,占比(24%)最大;反向对接结果显示该化舍物与Tankyrase 1蛋白(PDB ID:4TOR)的结合能(E=-66 kcal/mol)最低;预测该化合物的活性为0.61μmol/L,荧光偏振实验测得化合物1与Tankyrase 1蛋白的结合力Ki=(0.15±0.01) μmol/L,属于中等抑制,Western blot表明在SW480细胞中化合物1使Tankyrase 1蛋白的表达下降;且分子动力学结果显示对接构象与该靶点已报道的抑制荆类似.结论 经过对桂枝中酚类提取物木脂素衍生物的反向找靶,以及活性测试确定其对Tankyrase 1蛋白具有潜在的抑制活性.
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文献信息
篇名 桂枝中酚类提取物潜在作用靶点的探索
来源期刊 南京中医药大学学报 学科 医学
关键词 桂枝 木脂素衍生物 神经保护 反向找靶 Tankyrase 1蛋白
年,卷(期) 2019,(3) 所属期刊栏目 实验研究
研究方向 页码范围 319-325
页数 7页 分类号 R284
字数 4292字 语种 中文
DOI 10.14148/j.issn.1672-0482.2019.0319
五维指标
作者信息
序号 姓名 单位 发文数 被引次数 H指数 G指数
1 王小龙 南京中医药大学药学院 18 42 4.0 5.0
2 薛鑫 南京中医药大学药学院 5 2 1.0 1.0
3 张海晴 南京中医药大学药学院 1 0 0.0 0.0
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研究主题发展历程
节点文献
桂枝
木脂素衍生物
神经保护
反向找靶
Tankyrase 1蛋白
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
南京中医药大学学报
双月刊
1672-0482
32-1247/R
大16开
南京市仙林大道138号
28-232
1959
chi
出版文献量(篇)
4098
总下载数(次)
9
相关基金
国家自然科学基金
英文译名:the National Natural Science Foundation of China
官方网址:http://www.nsfc.gov.cn/
项目类型:青年科学基金项目(面上项目)
学科类型:数理科学
论文1v1指导