从江香猪IGF-1和IGF-2基因的克隆、表达及生物信息学分析

• 作者: 倪萌萌 倪锴 卢贤君 吴小敏 朱晓锋 许厚强 谌颖莲 陈伟
• 来源期刊: 农业生物技术学报
• 学科: 农学
• 关键词: 从江香猪 类胰岛素样生长因子1/2基因(IGF-1/2) 遗传距离 基因表达
• 年，卷（期）: 2019,（8）
• 所属期刊栏目: 研究论文与报告
• 页码范围: 1382-1391
• 页数: 10页
• 分类号: S828.2
• 字数: 7053字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1674-7968.2019.08.006

摘要

从江香猪(Sus scrofa)具有生长迟缓、个体矮小等特征,与约克夏、杜洛克、长白等猪种相比,在医疗及模式动物的资源挖掘方面有着特殊的价值.本研究通过探讨从江香猪的类胰岛素样生长因子1/2基因(insulin-like growth factors-1/2,IGF-1/2)的生物信息学特征及在从江香猪和大白猪不同组织器官中的表达差异,初步明确从江香猪生长迟缓、个体矮小的原因,为探究微型猪种生长发育分子机制以及人体动物模型的研究提供基础数据.本研究以相同饲养条件下的同龄纯种从江香猪和大白猪作为实验材料,克隆了从江香猪IGF-1 (GenBank No.NM_214256.1)和IGF-2 (GenBank No.NM_213883.2)基因CDS区,并进行结构预测和功能分析;利用qRT-PCR技术分别检测从江香猪和大白猪心脏、肝脏、脾脏、肺脏、肾脏、大肠、小肠、脂肪和背最长肌9个不同组织器官中IGF-1和IGF-2基因的mRNA水平.结果 发现,从江香猪IGF-1和IGF-2基因CDS区分别为435和577 bp,与GenBank登录的野猪(S.scrofa)的基因编码序列均一致;序列分析结果显示,IGF-1和IGF-2蛋白相对分子质量分别为14.390 44和20.312 51kD,理论等电点分别为9.34和10.00,不稳定系数为65.58和58.64;遗传进化分析得知,与其他12个物种比较,从江香猪IGF-J和IGF-2基因与野猪的遗传距离最近;qRT-PCR结果显示,IGF-1基因在从江香猪肺、小肠和大肠中表达量最高(P＜0.05),而在大白猪背最长肌中的表达量极显著高于其他组织器官(P＜0.01);IGF-2基因在从江香猪肝脏和肺脏中的表达量高,显著高于其他组织器官(P＜0.05),而在大白猪中背最长肌和心脏的表达量极显著高于其他组织(P＜0.01).本研究结果揭示了IGF-1和IGF-2基因在从江香猪和大白猪中的表达差异性,为进一步探索微型猪种的生长发育机制提供了基础数据.