中国对虾甘氨酸脱羧酶的基因克隆、表达及其与抗WSSV的关联分析

• 作者: 史晓丽 孔杰 孟宪红 张莹雪 曹宝祥 曹家旺 栾生 罗坤 陈宝龙
• 来源期刊: 渔业科学进展
• 学科: 农学
• 关键词: 中国对虾 甘氨酸脱羧酶 基因克隆 表达 关联分析
• 年，卷（期）: 2019,（2）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 74-82
• 页数: 9页
• 分类号: Q785|S966.1
• 字数: 5574字
• 语种: 中文
• DOI: 10.19663/j.issn2095-9869.20171219002

摘要

本研究采用RACE技术克隆获得中国对虾(Fenneropenaeus chinensis)甘氨酸脱羧酶基因(FcGLDC)的全长cDNA及DNA序列,并对其进行生物信息学分析.结果 显示,FcGLDC基因的cDNA全长为3481bp,其中,ORF为2829bp,5'UTR长17bp,3'UTR长86bp.完整的阅读框编码942个氨基酸,分子量为104.66 kDa,预测的理论等电点为6.51.FcGLDC基因DNA序列全长共4964 bp,包含12个外显子和11个内含子.同源性及系统进化分析显示,FcGLDC基因与节肢动物的GLDC基因聚为一类;氨基酸序列比对发现,FcGLDC基因的蛋白序列与节肢动物的相似度最高,与内华达白蚁(Zootermopsis nevadensis)、体虱(Pediculus humanus corporis)和白纹伊蚊(Aedes albopictus)的相似度分别为71％、68％和68％.在鳃、肝胰腺和肌肉中的荧光定量PCR结果显示,FcGLDC在肌肉中的相对表达量最高,鳃中最低.WSSV感染后,该基因在鳃、肝胰腺和肌肉中呈现出了不同的时空表达特点.使用直接测序法结合质谱法,在该基因内部发现4个SNP位点,但是各位点与抗WSSV性状均不相关(P＞0.05).本研究表明,FcGLDC基因在对虾感染WSSV后的应答反应中或起一定作用.