百脉根PIN基因家族的鉴定与分析

• 作者: 丘日光 吕赟 吴佳海 宋莉 杨仕梅
• 来源期刊: 河南农业科学
• 学科: 农学
• 关键词: 百脉根 生长素输出载体蛋白 PIN基因家族 生物信息学分析
• 年，卷（期）: 2019,（8）
• 所属期刊栏目: 作物栽培·遗传育种
• 页码范围: 39-48
• 页数: 10页
• 分类号: S567
• 字数: 4655字
• 语种: 中文
• DOI: 10.15933/j.cnki.1004-3268.2019.08.006

摘要

生长素输出载体蛋白PIN-formed(PIN)是一类调控植物生长素极性运输的重要载体元件,与植物生长发育密切相关.利用生物信息学方法对百脉根(Lotus corniculatus)PIN基因家族成员(LjPIN)进行筛选、鉴定,并对其结构特征、系统进化、编码蛋白质性质、顺式作用元件组成和表达特性等进行研究,为其功能鉴定及利用奠定基础.结果表明,百脉根基因组中含有27个LjPIN成员,主要分布在1—5号染色体上;27个LjPIN基因含8个可变剪切位点,编码35个蛋白质;除了LjPIN4、LjPIN13、LjPIN23基因外,其他LjPIN基因均含有内含子,内含子数和外显子数均为1～10个;LjPIN与拟南芥AtPIN、大豆GmPIN在进化关系上较接近,与水稻OsPIN较远;LjPIN蛋白大多为碱性的两性稳定蛋白质,一般含有5种保守基序,基序数量2～9个;LjPIN基因除了含有顺式作用基本元件CAAT-box和TATA-box外,还含有光响应、激素响应及生长发育相关的调控元件;11个LjPIN基因在根、茎、叶、花和不同形成时期种子中呈时空差异表达.