油茶 CLE 基因家族的鉴定

• 作者: 赵松子 江西省林业科学院·江西省油茶种质资源保护与利用实验室
• 来源期刊: 南方林业科学
• 关键词: 油茶 CLE 产量 CLAVATA3 小分泌蛋白
• 年，卷（期）: 2023,（1）
• 页码范围: 7-11
• 页数: 5页
• 语种: 中文
• DOI: 10.16259/j.cnki.36-1342/s.2023.01.002

摘要

CLE基因家族编码小分泌蛋白，参与调节植物的生长与发育；CLAVATA3(CLV3)是该家族中与作物产量相关的基因，其序列短、相似度低，鉴定该基因比较困难。本研究利用生物信息学的方法对油茶(Camellia oleifera)基因组数据进行了分析，从注释的蛋白质数据中鉴别出11个油茶CLE基因；开发了一套从基因组序列中预测CLV3基因的方法，鉴别出1个油茶CLV3基因；基因表达分析表明，CoCLV3在种仁、柱头、叶等部位的表达水平较高；利用CLE基因家族蛋白质序列的CLE基序进行比对分析并构建进化树，结果表明，CoCLV3是AtCLV3的同源基因。