扬子鳄IL-1β基因的克隆和生物信息学分析及表达量的测定

• 作者: 苏玉鑫 费荣梅
• 来源期刊: 中国兽医科学
• 学科: 农学
• 关键词: IL-1β 扬子鳄 序列分析
• 年，卷（期）: 2019,（10）
• 所属期刊栏目: 预防兽医学
• 页码范围: 1305-1314
• 页数: 10页
• 分类号: S852.42
• 语种: 中文
• DOI: 10.16656/j.issn.1673-4696.2019.0179

摘要

为研究扬子鳄IL-1β基因的序列、结构以及生物学功能,通过采取成年健康扬子鳄外周血液,进行淋巴细胞的提取,再提取其mRNA,反转录得到cDNA,应用设计的引物进行PCR扩增,克隆出扬子鳄IL-1β基因的CDS区域,对得到测序正确的序列进行生物信息学分析、同源性分析以及进化树构建,同时选取6种组织对扬子鳄IL-1β3不同时期的表达水平进行测定和分析.结果 显示,扬子鳄IL-1β基因的完整ORF序列为801 bp,共编码266个氨基酸,理论上该成熟蛋白的分子质量为30 ku,等电点为5.15,总平均亲水指数为-0.254.同源性分析和进化树构建结果显示,扬子鳄IL-1β基因与美国短吻鳄的同源性高达91.9％,且处于进化树的同一个分支.IL-1β表达量在血液中呈现最高,非冬眠期普遍比冬眠期表达量高.本试验研究结果为扬子鳄IL-1β3基因的表达调控机制和功能研究奠定了基础,也为扬子鳄的健康养殖和种群保护奠定了一定基础.