杭州地区相同分子型别的单核细胞增生李斯特菌临床和食品分离株基因组分析

• 作者: 俞骅 刘涛 张蔚 楼秀芹 汪皓秋 潘劲草 王旭初 董华丽
• 来源期刊: 中国人兽共患病学报
• 学科: 医学
• 关键词: 单核细胞增生李斯特菌 高通量测序 单核苷酸多态性 毒力基因 非编码RNA
• 年，卷（期）: 2019,（8）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 699-705,710
• 页数: 8页
• 分类号: R378.99
• 字数: 3305字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1002-2694.2019.00.129

摘要

目的 研究杭州地区分子型别相同的临床和食品来源单核细胞增生李斯特菌在基因组水平的分子差异及进化关系.方法 利用高通量基因组测序和生物信息学分析方法对脉冲场凝胶电泳(Pulse-field gel electrophoresis,PFGE)型别一致的1株临床来源和6株食品来源的ST8型菌株进行基因组共线性、ncRNAs分布和毒力基因携带分析.联合NCBI Assembly数据库中ST8型菌株基因组,构建基于全基因组SNPs位点的进化树,进行溯源分析.结果 杭州地区临床和食品来源的菌株基因组共线性一致.菌株在毒力基因lmo0036和lmo2396的序列和rli48,rli62和rliG分子,质粒pLmA144的分布存在差异.基因组SNPs进化树显示ST8型菌株呈现高度同源.食品分离株中12-004与临床株12-103的进化上最接近,只有16个SNPs差异.结论 杭州市场近年肉类食品中存在遗传进化高度相似的一群ST8型单核细胞增生李斯特菌.杭州单核细胞增生李斯特菌临床分离株感染可能来自这群菌株.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	潘劲草		72	465	12.0	18.0
2	王旭初		21	80	4.0	8.0
3	俞骅		25	161	7.0	12.0
4	刘涛		10	14	2.0	3.0
5	张蔚		35	291	10.0	16.0
6	汪皓秋		36	144	7.0	10.0
7	董华丽		20	88	6.0	7.0
8	楼秀芹		9	29	4.0	5.0