龙眼Hsf基因家族全基因组鉴定及体胚发生过程中的表达分析

• 作者: 孙雪丽 彭丽云 林玉玲 王云 赖钟雄 陈晓慧 陈裕坤 高玉莹
• 来源期刊: 应用与环境生物学报
• 学科: 农学
• 关键词: 龙眼 热激转录因子家族 DlHsf成员鉴定 表达分析 miRNA预测
• 年，卷（期）: 2019,（2）
• 页码范围: 420-431
• 页数: 12页
• 分类号: S667.203
• 语种: 中文
• DOI: 10.19675/j.cnki.1006-687x.2018.06004

摘要

基于龙眼基因组数据库对龙眼Hsf(DlHsf)基因家族进行全基因组鉴定,并对其基因结构、启动子作用元件和CpG岛分布情况、编码蛋白的理化性质和进化情况以及它们在不同体胚发生阶段和不同组织器官的表达情况进行研究,同时对靶定DlHsf的miRNA进行预测分析.结果表明:DlHsf基因家族共20个成员,基因结构高度保守.它们编码的蛋白具有典型的DNA结合域(DBD),且均为不含信号肽的不稳定蛋白.启动子分析发现,该基因家族成员的启动子除典型的热激元件(HSE)外,还含有MYB元件等与逆境胁迫及生长发育相关的元件,DlHsfA1d、DlHsfA9a、DlHsfA9b和DlHsfC1启动子存在典型的CpG岛.进化树分析表明DlHsf可分为DlHsfA、D1HsfB和DlHsfC三类.qRT-PCR结果表明,DlHsf在胚性阶段(EC)和球形胚阶段(GE)表达量较高,在不完全胚性紧实结构阶段(ICpEC)表达量较低,在龙眼体胚发育过程中呈现“V”状趋势,表明DlHsf可能主要在EC、GE阶段发挥作用.此外,DlHsf家族成员在花芽和花蕾中表达量较高,其次是在果肉中,推测DlHsfs可能与龙眼花发育等生长过程相关.psRNA Target预测结果表明DlHsf基因家族受到miRNA调控,且调控方式多样.本研究表明DlHsf功能多样,可能在龙眼生长发育、胁迫响应、DNA甲基化、组织器官特异表达等生物学过程中发挥作用.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	赖钟雄		473	4127	31.0	41.0
2	林玉玲		148	560	10.0	16.0
3	陈裕坤		48	97	5.0	7.0
4	陈晓慧		20	13	3.0	3.0
5	彭丽云		12	14	3.0	3.0
6	孙雪丽		14	17	2.0	4.0
7	王云		4	1	1.0	1.0
8	高玉莹		5	3	1.0	1.0