葡萄全基因组WRKY转录因子鉴定和分析

• 作者: 任凤山 杨阳 王咏梅 王鹏飞 苏玲 陈万钧
• 来源期刊: 黑龙江农业科学
• 关键词: 葡萄 WRKY 转录因子 进化分析 表达分析
• 年，卷（期）: 2019,（1）
• 所属期刊栏目: 遗传育种·生物技术
• 页码范围: 13-22
• 页数: 10页
• 字数: 5202字
• 语种: 中文
• DOI: 10.11942/j.issn1002-2767.2019.01.0013

摘要

为鉴定和分析葡萄全基因组中WRKY家族转录因子基因,利用生物信息学的方法,分析葡萄全基因组WRKY转录因子类型 、进化分析 、染色体定位 、基因结构 、保守元件和基因表达模式.结果表明:葡萄全基因组中有56个WRKY转录因子.序列比对和系谱进化表明,分为 Ⅰ 、Ⅱ 和 Ⅲ 三个组,Ⅱ 组分为 Ⅱ-a、Ⅱ-b、Ⅱ-c、Ⅱ-d和 Ⅱ-e五个亚组.染色体定位表明,存在串联复制和分布不均现象,但是在3号染色体上无该家族基因定位.结构域和保守元件分析都说明葡萄WRKY(VvWRKY)家族的WRKY结构域是高度保守的.葡萄叶片中基因表达模式分析表明,VvWRKY家族的部分基因参与非生物胁迫.