胃肠道间质瘤c-Kit/PDGFRA基因Sanger法测序套峰产生的原因及解决方案

• 作者: 倪娟 娄丽萍 杨成 段裴 熊东亮 许三鹏
• 来源期刊: 临床与实验病理学杂志
• 学科: 医学
• 关键词: 胃肠道间质瘤 c-Kit/PDGFRA基因 Sanger法测序 套峰
• 年，卷（期）: 2019,（10）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 1195-1199
• 页数: 5页
• 分类号: R735.2
• 字数: 3148字
• 语种: 中文
• DOI: 10.13315/j.cnki.cjcep.2019.10.013

摘要

目的 探讨胃肠道间质瘤c-Kit/PDGFRA基因Sanger法测序套峰产生的原因及解决方案.方法 提取111例胃肠道间质瘤石蜡样本的基因组DNA,采用PCR-Sanger测序法检测其c-Kit基因(外显子9、11、12、13、14、17和18)与PDGFRA基因(外显子12、14和18)序列.选择套峰出现频率较高的c-Kit基因18号外显子作为实验对象,将其PCR扩增产物分为甲、乙两组(甲组将111例PCR扩增产物5μL加入2μL SAP-ExoI中,乙组将111例PCR扩增产物1μL加入2μL SAP-ExoI中)进行酶解纯化,并行Sanger法测序,比较两组测序结果 中出现套峰例数及突变例数的差异性.结果甲组c-Kit基因18号外显子测序结果中有95例(95/111,85.59％)出现明显套峰;乙组中有8例(8/111,7.21％)出现明显套峰;两组套峰例数差异有统计学意义(P<0.001).甲、乙两组111例c-Kit基因18号外显子测序结果中均有1例检测到突变,且突变位置及突变类型相同.结论 充分酶解PCR扩增产物能够显著优化测序结果,降低套峰出现频率,且对突变检测未见明显影响,为胃肠道间质瘤的c-Kit/PDGFRA基因的准确测序奠定基础.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	杨成	华中科技大学同济医学院附属同济医院病理研究所	30	114	6.0	8.0
2	倪娟	华中科技大学同济医学院附属同济医院病理研究所	24	106	6.0	8.0
3	许三鹏	华中科技大学同济医学院附属同济医院病理研究所	15	61	6.0	6.0
4	娄丽萍	华中科技大学同济医学院附属同济医院病理研究所	7	24	2.0	4.0
5	熊东亮	华中科技大学同济医学院附属同济医院病理研究所	3	0	0.0	0.0
6	段裴	华中科技大学同济医学院附属同济医院病理研究所	3	0	0.0	0.0