黄瓜PP2-A1蛋白的生物信息学分析

• 作者: 庞宁宁 杜长霞 柴里昂 樊怀福 王哲
• 来源期刊: 江苏农业科学
• 学科: 农学
• 关键词: 黄瓜 PP2-A1蛋白 分子生物信息学 亲水性 系统发育树
• 年，卷（期）: 2019,（2）
• 所属期刊栏目: 生物技术
• 页码范围: 46-49
• 页数: 4页
• 分类号: S642.201
• 字数: 3689字
• 语种: 中文
• DOI: 10.15889/j.issn.1002-1302.2019.02.010

摘要

韧皮部蛋白2(PP2)是植物特异性的韧皮部蛋白,通过参与植物调控其细胞内基因表达水平和产物活性来应对自然界中的各种胁迫,对于维持植物株体形态、体内物质运转和保护愈合植物伤口有重要意义.以前期克隆得到的黄瓜(Cucumis sativus)PP2-A1蛋白序列为对象,利用生物信息学方法,对黄瓜PP2-A1蛋白序列进行生物学功能分析.结果表明,黄瓜PP2-A1蛋白具有亲水性,比较不稳定,半衰期短,无信号肽段,没有跨膜结构,是定位在胞质的非分泌蛋白;结合对其二级结构和三级结构的预测分析,得出PP2-A1是以无规则卷曲和延伸链为主的片层结构;构建PP2的系统发育树,发现其与香瓜亲缘关系最近,同时预测其结构功能域,发现其具有1个典型的PP2结构功能域.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	王哲	浙江农林大学农业与食品科学学院	2	5	1.0	2.0
2	柴里昂	浙江农林大学农业与食品科学学院	4	5	1.0	2.0
3	庞宁宁	浙江农林大学农业与食品科学学院	1	1	1.0	1.0