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亚麻荠 FAD2-1和 FAD3-1编码蛋白的生物信息学分析
亚麻荠 FAD2-1和 FAD3-1编码蛋白的生物信息学分析
作者:
刘宝玲
孙岩
张莉
李润植
苑丽霞
薛金爱
高昌勇
原文服务方:
山西农业大学学报(自然科学版)
亚麻荠
ω-3与ω-6族脂肪酸
脂肪酸脱饱和酶(FAD)
生物信息学分析
摘要:
△‐12脂肪酸脱氢酶FAD2(fatty acid desaturase 2)和△‐15脂肪酸脱氢酶FAD3(fatty acid desaturase 3)是控制亚油酸(18∶2;ω‐6)和亚麻酸(18∶3;ω‐3)合成的限速酶,亦在植物抵御低温等环境胁迫反应中起重要作用。本文利用生物信息学工具分析了亚麻荠(Camelina sativ a)FAD2‐1和FAD3‐1编码蛋白的理化性质、二硫键、磷酸化位点、高级结构、保守域和功能系统进化等特征。结果表明,FAD2‐1和FAD3‐1编码蛋白理论pI相近(分别为8.39和8.42),然而前者不稳定系数(40.04)显著高于后者(29.46)。FAD2‐1蛋白的磷酸化位点为23个,多于 FAD3磷酸化位点(18个),预示FAD2‐1更易受翻译后调控。这两种蛋白均含有3个保守的组氨酸富集区(Hisbox ),且在C端含有内质网滞留信号,赋予其定位于内质网和催化双键形成的活性。 FAD2‐1的 a‐螺旋比例(45.31%)高于 FAD3‐1(33.16%),然而后者无规则卷曲比例(51.93%)大于前者(44.53%)。3D结构模拟显示,FAD2‐1和 FAD3‐1功能域大小和构象存在差异,这可能影响到底物选择性和催化效率。这些结果为全面解析亚麻荠种子油脂合成和ω‐3族脂肪酸富集的分子机理提供了科学参考。
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篇名
亚麻荠 FAD2-1和 FAD3-1编码蛋白的生物信息学分析
来源期刊
山西农业大学学报(自然科学版)
学科
关键词
亚麻荠
ω-3与ω-6族脂肪酸
脂肪酸脱饱和酶(FAD)
生物信息学分析
年,卷(期)
2016,(4)
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研究方向
页码范围
242-250
页数
9页
分类号
S565.9
字数
语种
中文
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ω-3与ω-6族脂肪酸
脂肪酸脱饱和酶(FAD)
生物信息学分析
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山西农业大学学报(自然科学版)
主办单位:
山西农业大学
出版周期:
双月刊
ISSN:
1671-8151
CN:
14-1306/N
开本:
大16开
出版地:
邮发代号:
创刊时间:
1957-01-01
语种:
chi
出版文献量(篇)
2896
总下载数(次)
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山西省自然科学基金
英文译名:
Shanxi Natural Science Foundation
官方网址:
http://sxnsfc.sxinfo.gov.cn/sxnsf/index.aspx
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学科类型:
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