金堂黑山羊IFN-γ基因克隆与组织表达分析

• 作者: 徐涛 曲秀龙 王利 魏勇
• 来源期刊: 黑龙江畜牧兽医（上半月）
• 学科: 农学
• 关键词: 金堂黑山羊 γ干扰素 差异表达 生物信息学 实时荧光定量PCR 克隆
• 年，卷（期）: 2019,（5）
• 所属期刊栏目: 畜牧科学
• 页码范围: 64-67,181
• 页数: 5页
• 分类号: S827|Q785
• 语种: 中文
• DOI: 10.13881/j.cnki.hljxmsy.2018.07.0125

摘要

为了解γ干扰素(IFN-γ)基因在金堂黑山羊体内的表达情况,采用RT-PCR法克隆金堂黑山羊IFN-γ基因,用ExPASy网站对其蛋白质结构进行生物信息学分析,并构建系统发育进化树,最后采用荧光定量PCR法检测了IFN-γ基因在健康金堂黑山羊5个组织器官中的表达情况.结果表明:金堂黑山羊IFN-γ基因长580 bp,蛋白质编码区(CDS区)为519 bp,共编码172个氨基酸,氨基酸序列有13个磷酸化位点,在第39位和第106位有2个糖基化位点,三级结构以α-螺旋为主,中间均匀夹杂着无规则卷曲,金堂黑山羊IFN-γ是一种带正电荷的不稳定的亲水性蛋白质;金堂黑山羊与山羊、绵羊、野水牛IFN-γ基因的开放阅读框(ORF)序列同源性均为98％;实时荧光定量PCR检测到IFN-γ在健康金堂黑山羊各组织器官中表达量不同,在脾脏中的相对表达量最高,在心脏和肌肉中几乎没有表达.说明IFN-γ基因较为保守,可能参与山羊的免疫应答反应.