甘薯4-香豆酸辅酶A连接酶基因的生物信息学鉴定和表达分析

• 作者: 唐力琼 徐靖 朱红林 林延慧 王效宁 王新华 韩义胜
• 来源期刊: 西北植物学报
• 学科: 生物学
• 关键词: 甘薯 4-香豆酸辅酶A连接酶(4CL) 绿原酸 花青素 表达分析
• 年，卷（期）: 2020,（4）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 581-587
• 页数: 7页
• 分类号: Q786|Q789
• 字数: 3678字
• 语种: 中文
• DOI: 10.7606/j.issn.1000-4025.2020.04.0581

摘要

4-香豆酸辅酶A连接酶(4-coumarate:CoA ligase,4CL)在苯丙烷类代谢途径中具有重要调控作用.该研究利用转录组数据在甘薯品种QS48中鉴定了11个4CL基因,并将这些基因命名为Ib4CL1～Ib4CL11.序列比对和功能域分析发现,11个Ib4CL蛋白均具有典型的4CL结构特征,包含保守的Box Ⅰ和BoxⅡ的结构域.进化和保守基序分析显示,Ib4CL1和Ib4CL2属于Ⅰ类4CL,Ib4CL3属于Ⅱ类4CL,而Ib4CL4～Ib4CL11属于4CL类似蛋白.转录组数据和荧光定量PCR分析显示,Ib4CL3和Ib4CL10在甘薯QS48的叶中转录表达水平显著高于茎和块根,与绿原酸的积累呈正相关关系;Ib4CL4和Ib4CL8在嫩叶中表达较高,与花青素的积累密切相关.研究结果为进一步揭示甘薯4CL基因在苯丙烷类代谢途径中的功能奠定了基础.