猪细小病毒7型广西分离株全基因组序列分析

• 作者: 刘云霞 孙文超 曹亮 汪伟 田明尧 郑敏 郭丹丹 金宁一 钱爱东 鲁会军
• 来源期刊: 中国兽医学报
• 学科: 农学
• 关键词: 猪细小病毒7型 基因插入 流行病学
• 年，卷（期）: 2020,（3）
• 所属期刊栏目: 预防兽医学
• 页码范围: 457-462
• 页数: 6页
• 分类号: S852.65
• 语种: 中文
• DOI: 10.16303/j.cnki.1005-4545.2020.03.03

摘要

采集2017年中国广西壮族自治区部分地区猪组织样品,并对PPV7的流行情况进行调查分析.采集健康猪和患病猪样品的PPV7感染率分别为66.7％和84％.此外健康猪和患病猪PCV2共感染率分别为51.74％和77.33％.二者的高感染率表明PPV7可能与PCV2感染存在一定关系.随机选取3份PPV7阳性样品进行主要结构基因测序,并进行系统进化分析.结果 显示,3份样品中全基因组序列同源性为94.1％～99.6％,NS1基因核苷酸序列同源性为96.0％～100％.cap基因核苷酸序列同源性为93.9％～97.6％.与PPV7参考株相比,NS1基因同源性为94.2％～97.6％,cap同源性为87.4％～95.0％.在3株PPV7全长基因组,其cap基因分别编码474,470及469个氨基酸,而作为参考的PPV7 42株则编码469个氨基酸,cap基因序列变异导致cap编码区域氨基酸序列的增加.