郑麦369 ω-醇溶蛋白基因的克隆及生物信息学分析

• 作者: 吴政卿 周正富 徐福新 晁岳恩 李文旭 柳东阳 雷振生
• 来源期刊: 河南农业大学学报
• 学科: 农学
• 关键词: 小麦 ω-醇溶蛋白 基因克隆 生物信息学
• 年，卷（期）: 2020,（1）
• 所属期刊栏目: 作物科学
• 页码范围: 11-18
• 页数: 8页
• 分类号: S512.1
• 字数: 5581字
• 语种: 中文

摘要

以黄淮麦区主推小麦品种郑麦369为材料,利用简并引物和PCR扩增技术对其ω-醇溶蛋白基因进行克隆,获得15条ω-醇溶蛋白核苷酸序列(分别命名为ZM369-1～ZM369-15).NCBI BLAST分析表明,克隆序列与已知序列的相似度均为82％～99％,推断其为ω-醇溶蛋白基因家族基因.通过FGENESH在线软件预测显示,ZM369-1和ZM369-15具有完整的开放阅读框,分别可编码318,407个氨基酸残基;其余13条序列均因内部提前出现1个或多个终止密码子,推测其为假基因.进一步分析显示,15个基因推导的氨基酸序列均具有ω-醇溶蛋白典型分子结构特征,其中ZM369-15属于未曾报道过的ARP类型,同时在重复区存在1个半胱氨酸残基的插入.此外,在NCBI数据库中没有找到与ZM369-1和ZM369-15相似度高的ω-醇溶蛋白氨基酸序列,推测其为新ω-醇溶蛋白基因.CD免疫肽识别分析表明,免疫肽段Gli-ωt在15条氨基酸序列中均有分布,免疫肽段Gli-ω1只分布于假基因推导得到的氨基酸序列中.系统进化树分析表明,本研究克隆得到的15个基因分别来源于A,D基因组;相同基因组来源的ω-醇溶蛋白基因大都可形成相对集中的分支,表明其具有一定的基因组特异性;相同类型ω-醇溶蛋白基因都能形成相对集中的分支,推测其类型与进化有关.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	雷振生		2	59	1.0	2.0
5	吴政卿	河南省农业科学院小麦研究所	56	498	13.0	20.0
6	晁岳恩	河南省农业科学院小麦研究所	8	36	2.0	6.0
7	李文旭	河南省农业科学院小麦研究所	6	3	1.0	1.0
8	柳东阳		2	6	1.0	2.0
9	周正富	河南省农业科学院小麦研究所	5	9	1.0	3.0
10	徐福新	河南省农业科学院小麦研究所	8	52	4.0	7.0