环湖牦牛瘤胃微生物区系特征及性别之间的差异

• 作者: 付弘贇 刘宏金 徐世晓 胡林勇 艾德强 赵建忠 陈永伟 韩学平
• 来源期刊: 动物营养学报
• 学科: 农学
• 关键词: 牦牛 16SrDNA 瘤胃 微生物区系 性别 TAX4FUN
• 年，卷（期）: 2020,（1）
• 所属期刊栏目: 反刍与草食动物营养与饲料
• 页码范围: 234-243
• 页数: 10页
• 分类号: S823
• 字数: 5258字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1006-267x.2020.01.029

摘要

本试验旨在研究环湖牦牛瘤胃微生物区系特征及性别之间的差异.随机挑选4～5岁环湖牦牛健康公牛5头[平均体重为(228.0±19.4)kg]和母牛5头[平均体重为(198.0±8.4)kg],采用16S rDNA扩增子高通量测序的方法研究公、母牦牛瘤胃微生物区系特征和性别之间的差异.结果表明:2个性别间瘤胃微生物在门水平上组成相似,其中拟杆菌门(Bacte-roidetes)、疣微菌门(Verrucomicrobia)和厚壁菌门(Firmicutes)是优势菌门,样品中平均相对丰度分别为51.74％、15.00％和14.34％.在属水平上,普氏菌属_1(Prevotella_1)、理研菌科RC9肠道群(Rikenellaceae_RC9_gut_group)和普雷沃氏菌科_UCG-001(Prevotellaceae_UCG-001)是优势菌属,平均相对丰度分别为16.11％、7.74％和3.43％.Alpha多样性指数中,公牛的Sobs指数为2689,极显著高于母牛(P<0.01),其余指数无显著性别差异(P>0.05).主坐标分析(PCoA)和相似性分析(Anosim)结果说明2个性别之间瘤胃微生物区系存在明显差异.在属水平上,公牦牛Rikenellaceae_RC9_gut_group的相对丰度显著高于母牦牛(P<0.05),母牦牛Pre-votella_1、毛螺菌科AC2044群(Lachnospiraceae_AC2044_group)、Saccharofermentans、Anaero-vorax和Elusimicrobium的相对丰度显著高于公牦牛(P<0.05).瘤胃微生物TAX4FUN预测功能比较发现,公、母牦牛瘤胃微生物功能在糖类代谢、氨基酸代谢、脂肪代谢及疾病相关等功能存在差异.从上述分析来看,性别对牦牛瘤胃微生物区系的组成有显著影响,尤其是在属水平上差异较大.