甘薯脱水素基因IbDHN1的克隆、 生物信息学及表达模式分析

• 作者: 刘思媛 孟小庆 张成彬 朱明库 李宗芸
• 来源期刊: 江苏师范大学学报（自然科学版）
• 学科: 农学
• 关键词: 甘薯 脱水素 生物信息学 表达模式分析
• 年，卷（期）: 2020,（2）
• 所属期刊栏目: 甘薯生物学与产业技术
• 页码范围: 37-41
• 页数: 5页
• 分类号: Q812|S531
• 字数: 4713字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.2095-4298.2020.02.008

摘要

脱水素在植物胁迫应答过程中具有保护细胞蛋白及细胞膜等重要功能,但目前甘薯中尚未见脱水素相关基因的研究报道.以栽培种徐薯22为研究材料,应用转录组测序技术,首次从甘薯中筛选出1个显著受盐胁迫诱导的脱水素基因,并命名为IbD H N1.根据RNA-seq测序结果并参考六倍体甘薯基因组序列设计引物,从徐薯22中克隆出IbD H N1基因的全长编码区序列,随后对该基因序列进行生物信息学分析,并应用qRT-PCR方法检测其表达模式.结果表明:IbD H N1基因包含1个639 bp的开放阅读框,编码212个氨基酸残基;蛋白特性预测结果显示,IbDHN1蛋白定位于细胞核,且含有多个磷酸化位点,序列多重比对显示IbDHN1与其他植物脱水素蛋白序列具有高度相似性;qRT-PCR分析显示,IbD H N1基因的表达受盐和干旱胁迫处理的显著诱导.