基于生物信息学分析RSK1在乳腺癌中的表达及其预后预测价值

• 作者: 刘司南 刘昌 林婷 王铮 高洁 黄启超 龙云祥
• 来源期刊: 中国癌症防治杂志
• 学科: 医学
• 关键词: 乳腺癌 RSK1 预后 标志物 生物信息学
• 年，卷（期）: 2020,（4）
• 所属期刊栏目: 临床研究
• 页码范围: 441-446
• 页数: 6页
• 分类号: R737.9
• 字数: 3666字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1674-5671.2020.04.14

摘要

目的 探讨核糖体S6蛋白激酶1(ribosomal S6 protein kinase type 1,RSK1)在乳腺癌中的表达及其预后预测价值.方法 基于Protein Atlas数据库比较乳腺癌组织及正常乳腺组织中RSK1表达差异.基于TCGA-BRCA及GEO提取RSK1 mRNA表达数据,基于TCGA-RPPA提取RSK1蛋白表达数据,分析RSK1 mRNA及蛋白表达水平及其与乳腺癌总体预后的关系.结果 数据集免疫组化分析结果显示,乳腺癌组织RSK1蛋白表达水平较正常组织低.TCGA-BRCA数据单因素和多因素Cox回归分析均显示RSK1 mRNA高表达组患者总体预后较好,分层分析结果显示女性、年龄≤60岁、Ⅰ～Ⅱ期、浸润性乳腺癌、无区域淋巴结转移(N0)以及无远处转移(M0)的高表达RSK1 mRNA患者总体预后较好.GEO 9个基于基因芯片数据集的荟萃结果与其相一致(HR=0.69,95％CI:0.56～0.86,P=0.002).TCGA-RPPA数据显示RSK1蛋白高表达组患者总体预后较好(HR=0.49,95％CI:0.27～0.89,P=0.011),不同乳腺癌分期中,早期患者RSK1 mRNA(HR=0.61,95％CI:0.39～0.95,P=0.025)和蛋白(HR=0.43,95％CI:0.22～0.84,P=0.008)高表达组总体预后较好.结论 RSK1高表达与乳腺癌患者较好的总体预后相关,RSK1可能是预测乳腺癌患者总体预后的标志物.