扬州蚕豆病毒病的鉴定及野豌豆潜隐病毒M扬州分离物基因组克隆及其序列分析

• 作者: 庄新建 张坤 徐红梅 甘海峰 臧颖 贺振 陈雯
• 来源期刊: 植物病理学报
• 学科: 农学
• 关键词: 蚕豆病毒 siRNA测序 核苷酸 序列分析
• 年，卷（期）: 2020,（3）
• 所属期刊栏目: 细胞生物学、生理学、生物化学、分子生物学
• 页码范围: 311-319
• 页数: 9页
• 分类号: S432.41
• 语种: 中文
• DOI: 10.13926/j.cnki.apps.000422

摘要

对田间疑似病毒侵染的蚕豆样品,提取总RNA,分离siRNA,建库并通过高通量测序,其结果经velvet拼接组装,经Blastn与NCBI比对分析,发现该样品感染4种病毒:野豌豆潜隐病毒M(vicia cryptic virus M,VCV-M)、野豌豆潜隐病毒(vicia cryptic virus,VCV)、紫云英矮宿病毒(milk vetch dwarf virus,MDV)和三叶草黄脉病毒(clover yellow vein virus,ClYVV).其中,有14条VCV-M相关的contigs.RT-PCR扩增并拼接获得VCV-M-YZ基因组,其长度为3 434 nt,其5'-UTR和3'-UTR分别为142 nt和117nt,各自形成与该属代表病毒南方番茄病毒(southern tomato virus,STV)5'-UTR和3'-UTR相似的高级结构,且A+U含量均较高.VCV-M-YZ与已报道的VCV-M基因组序列一致性在98％以上.系统进化分析表明,VCV-M-YZ与已报道的VCV-M属于一个种,无明显的地理分布差异.本研究结果丰富了VCV-M群体的基因组遗传信息,为VCV-M的监测及深入研究提供了基础.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	张坤		13	10	2.0	3.0
2	陈雯		12	10	2.0	3.0
3	庄新建		4	0	0.0	0.0
4	徐红梅		6	1	1.0	1.0
5	甘海峰		7	3	1.0	1.0
6	贺振		25	48	4.0	6.0
7	臧颖		2	2	1.0	1.0