基于网络药理学和分子对接技术探讨自拟“清瘟汤”治疗新型冠状病毒肺炎的机制

• 作者: 卞晓岚 方洁 杨铭 郑岚 郑林 马诗瑜
• 来源期刊: 中国药业
• 学科: 医学
• 关键词: 新型冠状病毒 分子对接技术 清瘟汤 网络药理学 抗病毒 作用机制
• 年，卷（期）: 2020,（7）
• 所属期刊栏目: 新冠肺炎专题
• 页码范围: 1-9
• 页数: 9页
• 分类号: R285.5|R254.3
• 字数: 6317字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1006-4931.2020.07.001

摘要

目的 利用中药网络药理学和分子对接技术,探讨清瘟汤作用靶标与新型冠状病毒(SARS-CoV-2)之间的关联以及多成分、多靶标的治疗机制.方法 通过建立化学成分、靶点,筛选主要活性成分和靶标,用Cytoscape软件构建和分析网络,使用String对靶标进行GO及KEGG功能富集分析,采用Autodock软件对“清瘟汤”(QWT)主要活性成分与SARS-CoY-2的3C类似蛋白酶(3CLpro)和血管紧张素转换酶2 (ACE2)蛋白进行分子对接.结果 QWT中共有172个活性成分涉及480个靶标,其中大多数中药归胃经、肺经和脾经,27个活性成分(琥珀酸、香豆素、γ-氨基丁酸、谷氨酰胺、槲皮素、山柰酚、脯氨酸、赖氨酸、木犀草素、色氨酸、L-缬氨酸、胆碱、芹菜素、β-谷固醇、苯丙氨酸、丙氨酸、水杨酸、DL-缬氨酸、羽扇豆酚、腺苷、谷氨酸、熊果酸、大黄素、异鼠李素、黄豆苷元、柠檬酸、阿魏酸)与靶标关系最密切;QWT关键靶点涉及CASP3,CYP1A1,JUN,TP53,HMOX1,ICAM1,FOS,PPARG,CXCR4,SRC,TYR,B2M,MMP9, RPS27A, PSMD3, NPEPPS, CNDP2, TNF, AKT1, APP, NPY1 R, CTSS,PTGER3, GGCT, UBB, HLA-A,PTGS2, CXCL8, FUM, PSMC4等,重要靶标富集在感染性疾病、肺部痰病和免疫性疾病三大类疾病通路上,GO分类和KEGG通路富集主要调控抗炎、免疫、血管生成、钙通道等相关.分子对接结果显示,槲皮素、芹菜素、熊果酸、异鼠李素、羽扇豆酚与3CLpro和ACE2蛋白具有一定的亲和力.结论 QWT中的活性化合物主要作用于CASP3,CYP1A1,JUN,TP53,HMOX1等靶点,其中有5种化合物可与SARS-CoV-2的2种主要蛋白进行分子对接,QWT总体通过调节多条信号通路,从而可能产生抗SARS-CoV-2作用.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	卞晓岚		28	55	5.0	6.0
2	方洁		79	327	9.0	16.0
3	杨铭		59	465	13.0	20.0
4	郑岚		35	179	7.0	12.0
5	马诗瑜		8	28	2.0	5.0
6	郑林		4	28	2.0	4.0