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伯氏疟原虫静息巯基氧化酶的生物信息学分析和体外酶活检测
伯氏疟原虫静息巯基氧化酶的生物信息学分析和体外酶活检测
作者:
冯学敏
曹雅明
王俊瑞
郑文琪
韩艳秋
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
疟原虫
生物信息学
蛋白表达
伯氏疟原虫静息巯基氧化酶
摘要:
目的 克隆、表达伯氏疟原虫静息巯基氧化酶(Pb QSOX)基因,纯化重组PbQSOX蛋白(rPbQSOX),并对其生物信息学特点和酶活性进行分析. 方法 分别采用BLAST、SMART、ClustalW对PbQSOX蛋白的信号肽、蛋白结构域、活性位点、同源性进行分析;通过BLAST和MAGA5构建PbQSOX的系统进化树;应用SWISS-MODEL对PbQSOX蛋白的三级结构进行预测.BALB/c雌性小鼠经腹腔感染伯氏疟原虫(1×107/鼠),于感染后第4天提取疟原虫基因组DNA.PCR扩增PbQSOX基因,经测序正确后,将目的片段连接至原核表达载体pET30a(+),构建重组质粒pET30a(+)-PbQSOX.将鉴定正确的重组质粒转化至大肠埃希菌BL21中,经异丙基-β-D-硫代半乳糖苷(IPTG)诱导后,取菌液进行十二烷基硫酸钠-聚丙烯酰胺凝胶电泳(SDS-PAGE)和蛋白质免疫印迹(Western blotting)分析;应用镍氨三乙酸琼脂糖柱纯化可溶性的rPbQSOX,并以三(2-羧乙基)膦(TCEP)或二硫苏糖醇(DTT)为酶反应底物分析rPbQSOX的酶活性. 结果 BLAST分析结果鉴定出了PbQSOX大部分其他物种的同源基因.多序列蛋白比对与蛋白结构域分析结果显示,PbQSOX蛋白含1个信号肽,存在Trx1、ψErv和Erv/ALR结构域,但完全缺失了TⅨ2结构域.PbQSOX蛋白含3个关键的CXXC活化基序(C为半胱氨酸Cys,X为任意氨基酸),即CPAC、CRNC和CNYC;采用MAGA5邻接法构建的系统进化树显示,PbQSOX与约氏疟原虫QSOX(PyQSOX)的亲缘关系最近;SWISS-MODEL同源建模法分析结果显示,用已知的布氏锥虫QSOX(TbQSOX)可预测PbQSOX蛋白的三级结构.PCR扩增PbQSOX基因,获得1 486 bp目的条带,经测序为PbQSOX基因序列;pET30a (+)-PbQSOX质粒经N如Ⅰ、HindⅢ双酶切与测序鉴定正确.SDS-PAGE和Western bloting分析结果显示,rPbQSOX重组蛋白主要以可溶形式表达,相对分子质量约59 000.纯化后的rPbQSOX对TCEP的催化活性为0.84±0.18,DTT的催化活性为0.78±0.14 (P< 0.01). 结论 PbQSOX蛋白为单Trx1结构域的伯氏疟原虫静息巯基氧化酶,构建、表达的rPbQSOX蛋白为可溶性蛋白,具有一定的静息巯基氧化酶催化活性.
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文献信息
篇名
伯氏疟原虫静息巯基氧化酶的生物信息学分析和体外酶活检测
来源期刊
中国寄生虫学与寄生虫病杂志
学科
医学
关键词
疟原虫
生物信息学
蛋白表达
伯氏疟原虫静息巯基氧化酶
年,卷(期)
2020,(2)
所属期刊栏目
论著
研究方向
页码范围
159-165
页数
7页
分类号
R382.319
字数
语种
中文
DOI
10.12140/j.issn.1000-7423.2020.02.005
五维指标
作者信息
序号
姓名
单位
发文数
被引次数
H指数
G指数
1
韩艳秋
内蒙古医科大学附属医院检验科
85
364
10.0
15.0
2
曹雅明
中国医科大学基础医学院免疫学教研室
140
540
11.0
19.0
3
王俊瑞
内蒙古医科大学附属医院检验科
41
126
7.0
10.0
4
郑文琪
内蒙古医科大学附属医院检验科
2
3
1.0
1.0
5
冯学敏
内蒙古医科大学附属医院外科实验室
1
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传播情况
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引文网络
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共引文献
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(26)
节点文献
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同被引文献
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生物信息学
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伯氏疟原虫静息巯基氧化酶
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
中国寄生虫学与寄生虫病杂志
主办单位:
中华预防医学会
中国疾病预防控制中心寄生虫病预防控制所
出版周期:
双月刊
ISSN:
1000-7423
CN:
31-1248/R
开本:
大16开
出版地:
上海市瑞金二路207号
邮发代号:
4-362
创刊时间:
1983
语种:
chi
出版文献量(篇)
3255
总下载数(次)
2
总被引数(次)
21973
相关基金
国家自然科学基金
英文译名:
the National Natural Science Foundation of China
官方网址:
http://www.nsfc.gov.cn/
项目类型:
青年科学基金项目(面上项目)
学科类型:
数理科学
期刊文献
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中国寄生虫学与寄生虫病杂志2020年第5期
中国寄生虫学与寄生虫病杂志2020年第4期
中国寄生虫学与寄生虫病杂志2020年第3期
中国寄生虫学与寄生虫病杂志2020年第2期
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